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标题: 如何聚合物单链弯曲？ [打印本页]

作者
Author: samuel 时间: 2024-12-29 16:47
标题: 如何聚合物单链弯曲？
请问一下，我现在得到一个聚合度比较高的聚合物单链，是直的，聚合物由charmm-gui得到的。放进去盒子之前要做些什么操作能让它弯曲一下，以便更好的放进盒子进行后续模拟？

作者
Author: liuxdhs 时间: 2024-12-29 20:55
简单跑个md就可以蜷缩在一起了。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-12-29 22:57
真空下直接模拟单个聚合物，或者用下文提到的Avogadro里手动拉动分子的做法把分子手动拉得比较卷曲
利用Gaussian或ORCA程序把分子结构拉直的几种方法
http://sobereva.com/594（http://bbs.keinsci.com/thread-22945-1-1.html）

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