计算化学公社

标题: 半胱氨酸形成的硫醚四面体的下一步,氧负离子进攻优先还是硫夺取氢质子优先?. [打印本页]

作者
Author:
zep    时间: 2024-12-29 23:28
标题: 半胱氨酸形成的硫醚四面体的下一步,氧负离子进攻优先还是硫夺取氢质子优先?.
各位老师好,遇见酶催化形成硫醚四面体结构,中性偏碱的条件下,遇到一个难题不知道进攻优先级的问题像各位老师请教,
①氧负离子进攻形成碳氧双键,形成硫负离子夺取质子供体氢
②硫先夺取质子形成硫正离子,进而氧负离子进攻。
不知道哪个应该优先?请各位老师赐教


作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-12-30 04:29
大概率走(1)途径。一方面,硫醚的碱性很弱,难以从羧酸夺质子;另一方面,这里反应物消除掉硫负离子很可能是热力学有利的,不需要质子化来辅助
作者
Author:
zep    时间: 2024-12-30 09:18
wzkchem5 发表于 2024-12-30 04:29
大概率走(1)途径。一方面,硫醚的碱性很弱,难以从羧酸夺质子;另一方面,这里反应物消除掉硫负离子很可 ...

好的多谢老师指教,顺便请教一下如果此处硫基团换成氨基,是不是应该先氨基质子化带正电,氧负离子再进攻脱落氨,碱性条件,因为看文献中似乎有这种例子。
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-12-30 17:37
zep 发表于 2024-12-30 02:18
好的多谢老师指教,顺便请教一下如果此处硫基团换成氨基,是不是应该先氨基质子化带正电,氧负离子再进攻 ...

对,因为氮负离子碱性太强了,离去性能太弱,与此同时胺很容易被羧基质子化
作者
Author:
zep    时间: 2024-12-30 18:34
wzkchem5 发表于 2024-12-30 17:37
对,因为氮负离子碱性太强了,离去性能太弱,与此同时胺很容易被羧基质子化

好的好的多谢王老师指教,感谢




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3