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标题: 求助gmx_MMPBSA计算pro-ligand结合自由能报错问题 [打印本页]

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Author: yph 时间: 2025-1-2 15:54
标题: 求助gmx_MMPBSA计算pro-ligand结合自由能报错问题
各位老师好，我使用charmm-gui生成蛋白和小分子的gromacs文件并进行MD后使用gmxMMPBSA进行结合自由能计算，但是报错了，具体信息贴在图片上（我重复官方的文件是没有问题的），想请教一下是什么原因？
‘’‘mpirun -np 40 gmx_MMPBSA -O -i mmpbsa.in -cs md.tpr -ci prolig.ndx -cg 1 13 -ct mdfit.xtc -cp topol.top（这个是我的运行命令）’‘’

’‘’&general
sys_name="Prot-Lig",
startframe=4000,
endframe=5000,
/
&gb
igb=5, saltcon=0.150,
/‘’‘这个是我的gmxMMPBSA输入文件

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