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标题: 做IRC时候出现的情况 [打印本页]

作者
Author: zc000 时间: 2017-2-21 08:19
标题: 做IRC时候出现的情况
本帖最后由 zc000 于 2017-2-21 08:23 编辑

请问，我在做焦炭与N2O反应的时候，优化过渡态后做IRC分析，结果出现下图1，左边的有一点波动，这个结果能用么，应该怎么处理一下？做计算的时候命令行为图2，还有就是，我给定最大步数的时候，左右两边点数不对称而且跟我设定的步数不一样？

作者
Author: 杨小狗 时间: 2017-2-21 08:54
IRC只是为了验证过渡态是不是找的很准确，与反应路径无关，所以是可用的

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2017-2-21 09:03
本帖最后由我本是个娃娃于 2017-2-21 10:06 编辑

如果你非要追求平滑，那就适当地增加步长，跳过那个突变的峰，说不定可以

大博士说是减小步长，看来是我学艺不精

作者
Author: sobereva 时间: 2017-2-21 09:51
对于验证过渡态的目的不平滑无所谓
非要平滑，放在文献里好看，就加上calcall或者减小步长，或者不用LQA
IRC走到极小点自动会停，不管是否达到你设的步数上限

作者
Author: zc000 时间: 2017-2-21 10:50

sobereva 发表于 2017-2-21 09:51
对于验证过渡态的目的不平滑无所谓
非要平滑，放在文献里好看，就加上calcall或者减小步长，或者不用LQA
...

谢谢Sob老师！

作者
Author: zc000 时间: 2017-2-21 10:51

杨小狗发表于 2017-2-21 08:54
IRC只是为了验证过渡态是不是找的很准确，与反应路径无关，所以是可用的

谢谢！

作者
Author: zc000 时间: 2017-2-21 11:04

sobereva 发表于 2017-2-21 09:51
对于验证过渡态的目的不平滑无所谓
非要平滑，放在文献里好看，就加上calcall或者减小步长，或者不用LQA
...

再请问Sob老师，在做过渡态反应速率计算的时候，利用kisthelp和您自己编的excel表格算一个反应的正反应速率和逆反应速率是怎么处理的？是先正向计算后，再逆向算一遍，得到正、逆向反应速率？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-2-21 11:47

zc000 发表于 2017-2-21 11:04
再请问Sob老师，在做过渡态反应速率计算的时候，利用kisthelp和您自己编的excel表格算一个反应的正反应速 ...

算正向速率就用正向势垒，算逆向速率就用逆向势垒，取决于你算哪个

作者
Author: zc000 时间: 2017-2-21 15:52

sobereva 发表于 2017-2-21 11:47
算正向速率就用正向势垒，算逆向速率就用逆向势垒，取决于你算哪个

好的，明白！谢谢老师

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