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标题: 求助在autodock对接蛋白时,在对接前和生成蛋白pdbqt后 氨基酸的原子类型发生变化 [打印本页]

作者
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fanfan要加油    时间: 2025-1-7 14:49
标题: 求助在autodock对接蛋白时,在对接前和生成蛋白pdbqt后 氨基酸的原子类型发生变化
(, 下载次数 Times of downloads: 29)
这是对接以前的蛋白的pdb文件 就是MET氨基酸关于硫原子是S

但是用autodock生成蛋白pdbqt以后就是变成了这个样子 SA (, 下载次数 Times of downloads: 25)
求讲解 目前我知道的是 这个最后一列代表的是这个意思 (, 下载次数 Times of downloads: 25) 但是我不明白的就是 之前met残基就没有二硫键 为什么用autodock生成了pdbqt文件以后就会变成SA 这个SA是代表着二硫键吗

作者
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KAIMISITERUI    时间: 2025-1-7 15:19
看后面的注释,SA原子类型显然表示“能够接受两个氢键的硫原子”,和二硫键没有任何直接关系。
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fanfan要加油    时间: 2025-1-8 13:50
KAIMISITERUI 发表于 2025-1-7 15:19
看后面的注释,SA原子类型显然表示“能够接受两个氢键的硫原子”,和二硫键没有任何直接关系。

好滴谢谢





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