计算化学公社

标题: 求助有关碳纳米管中盐溶液选用模拟力场回答审稿人的问题 [打印本页]

作者
Author:
zhufayan    时间: 2025-1-7 21:52
标题: 求助有关碳纳米管中盐溶液选用模拟力场回答审稿人的问题
本帖最后由 zhufayan 于 2025-1-14 11:18 编辑

各位大侠好,最近我们投了一篇理论计算的文章,我们在Gromacs MD计算时采用kbff 20 forcefield 力场对碳纳米管中盐溶液进行了理论模拟计算,审稿人提出“Why didn’t the authors use the typical 12-6 LJ potentials?”  “please explain the reason for the non-common LJ function used here.”的类似问题,请问我们用的力场参数是不是typical 12-6 LJ potentials?非常感谢

我们选用的itp文件请见附件或请参见下面:

#define _FF_KBFF20
;
; A Kirkwood-Buff Derived Force Field for Peptides and Proteins: KBFF20
;
; Reborn on 03/30/2021
;
[ defaults ]
; nbfunc        comb-rule        gen-pairs        fudgeLJ         fudgeQQ
  1                3                yes                 0.10                  0.50

#include "ffnonbonded.itp"
#include "ffbonded.itp"
#include "cmap.itp"



作者
Author:
sobereva    时间: 2025-1-8 06:02
又是什么前提都不交代,别人怎么知道non-common LJ function指的具体是什么东西




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