计算化学公社

标题: 求助不同预优化结构使用gaussian是否能得到相同结果 [打印本页]

作者
Author: gqinhao@163.com 时间: 2025-1-9 12:56
标题: 求助不同预优化结构使用gaussian是否能得到相同结果
各位老师好，我有一批分子结构需要用gaussian进行热力学数值计算并进行对比，前面有几个分子用的MMFF94力场进行预优化，然后现在有个分子用MMFF预优化完再用gaussian dft计算结构时SCF不收敛，但MM2能正常计算，想问下这会影响不同结构之间热力学数值的对比么？

我也比较好奇，比如同一个分子分别用MMFF94和MM2力场预优化，使用相同的方式进行opt freq计算最后结构是否会相同呢？

我知道dft是从头算，但是不是很清楚这个从头算是指只要分子固定，不管初始结构怎样，在相同的基组和泛函下都能优化得到相同结构，还是说在初始结构相同的情况下经过相同计算的结果是相同的。谢谢各位老师。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2025-1-9 13:13
与量子化学无关，这是常识问题，有的分子有多个稳定构象，不同量化程序、不同优化算法、不同初始结构，有可能导致优化结果是不同的局域极小点。如果体系极其刚性，只有一个局域极小点，也是全局极小点，那无论用什么方法优化，在KS-DFT给定的计算级别下最终都是同一个结构。这跟山脉山谷是一个道理。自行根据体系特点判断。

作者
Author: gqinhao@163.com 时间: 2025-1-9 13:18

zjxitcc 发表于 2025-1-9 13:13
与量子化学无关，这是常识问题，有的分子有多个稳定构象，不同量化程序、不同优化算法、不同初始结构，有可 ...

好的，谢谢老师

作者
Author: sobereva 时间: 2025-1-9 23:52

我也比较好奇，比如同一个分子分别用MMFF94和MM2力场预优化，使用相同的方式进行opt freq计算最后结构是否会相同呢？

问这种问题说明你应当了解构象搜索的知识。仔细看
构型和构象搜索程序Molclus主页：http://www.keinsci.com/research/molclus.html
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
Molclus FAQ
http://sobereva.com/730（http://bbs.keinsci.com/thread-50349-1-1.html）
gentor：扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html
使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

对于势能面复杂、极小点很多的柔性大体系，不同力场极有可能优化到不同极小点附近，因而进一步用DFT优化也会得到不同结果。这种情况需要用molclus做构象搜索，确保最后得到的是势能面最小点对应的结构。

作者
Author: gqinhao@163.com 时间: 2025-1-10 11:25

sobereva 发表于 2025-1-9 23:52
问这种问题说明你应当了解构象搜索的知识。仔细看
构型和构象搜索程序Molclus主页：http://www.keinsci. ...

好的，谢谢sob老师！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)