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标题: 新手求助关于跑完MD后如何截取某一帧里的两个分子 [打印本页]

作者
Author: 科研小白0126 时间: 2025-1-10 14:29
标题: 新手求助关于跑完MD后如何截取某一帧里的两个分子
各位老师好，我使用VMD时已将gro仅有的一帧删除了，然后载入xtc，通过save coordinates保存了最后一帧的xyz类型文件，但是这一帧里我所需要的特定分子该怎么截取出来呀，下面是截取出最后一帧的xyz文件，这里面完全看不出哪个是我所需要的分子，因为我是准备截取出两个分子做二聚体的量子化学计算的，望各位老师能予以指导，万分感谢

作者
Author: Loading0760 时间: 2025-1-10 16:16
你回到一开始的gro文件。记住那两个分子的index，然后在这里选取对应的行就好了。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-1-10 23:52
保存新文件的时候selected atoms里填上恰当的选择语句
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

作者
Author: 科研小白0126 时间: 2025-1-11 17:09

sobereva 发表于 2025-1-10 23:52
保存新文件的时候selected atoms里填上恰当的选择语句
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.c ...

感谢sob老师的指导

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