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标题: slurm24中mpirun 如何设置多核计算 [打印本页]

作者
Author: naxiangzi 时间: 2025-1-10 22:41
标题: slurm24中mpirun 如何设置多核计算
本帖最后由 naxiangzi 于 2025-1-10 22:46 编辑

环境centos8.5, hwloc,libevent,pmix,ucx,openmpi.
其中
pmix

wget https://github.com/openpmix/openpmix/releases/download/v5.0.3/pmix-5.0.3.tar.bz2
tar -xaf pmix-5.0.3.tar.bz2
cd pmix-5.0.3
./configure

复制代码

openmpi

wget https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v5.0/openmpi-5.0.6.tar.bz2
tar -xaf openmpi-5.0.6.tar.bz2
cd openmpi-5.0.6
./configure --with-hwloc --with-libevent --with-pmix

复制代码

slurm

cd slurm-24.05.4
# 这里要注意，如果安装了pmix库，这里一定要写上 --with-pmix否则构建时是不会编译pmix库的
# --enable-pam 开启pam
./configure --with-pmix --enable-pam

复制代码

slurm 编译加了 pmix ,这样加对嘛，是否还要加 openmpi 参数，要怎么加。
使用

nohup mpirun -np 74 lmp -in din.csh &

复制代码

top如下，是否是启用多核运行，因输出日志有 1 by 1 by 1 MPI processor grid，判断只使用1核，运行总体时间的确慢。请问如果没有开启，要怎么配置参数，谢谢

作者
Author: Santz 时间: 2025-1-11 14:15
slurm 编译时的 pmix 带具体的路径，可以同时带多个版本的 pmix 编译，完成之后的验证 srun --mpi=list. 另外建议开启 lua 支持，方便之后开启 job submit 插件。另外 pmix 5.0.3 版本略高，建议居中适配，部分 openmpi 版本不一定支持；还建议你编译一个使用 pmi2 的openmpi

作者
Author: naxiangzi 时间: 2025-1-11 15:05

Santz 发表于 2025-1-11 14:15
slurm 编译时的 pmix 带具体的路径，可以同时带多个版本的 pmix 编译，完成之后的验证 srun --mpi=list. 另 ...

srun --mpi=list
MPI plugin types are...
none
cray_shasta
pmi2
pmix
specific pmix plugin versions available: pmix_v5

复制代码

我的cpu是intel
我的slurm.conf 配置 MpiDefault=pmix，是不是设置不合理，应该设置 mpi2，还是什么
看了您给的文章，对 mpi,pmix 很晕，

还有编译 openmpi

wget https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v5.0/openmpi-5.0.6.tar.bz2
tar -xaf openmpi-5.0.6.tar.bz2
cd openmpi-5.0.6
./configure --with-hwloc --with-libevent --with-pmix

复制代码

参数是否要改为
./configure --with-hwloc --with-libevent --with-pmi2，还是多加一个变成
./configure --with-hwloc --with-libevent --with-pmix --with-pmix --with-pmi2

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