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标题: 关于gromacs跑动力学任务中断,出现CuDA error #719的问题 [打印本页]

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Soulmate    时间: 2025-1-21 10:28
标题: 关于gromacs跑动力学任务中断,出现CuDA error #719的问题

大家好,想请教大家一个问题:
  鄙人在跑蛋白-配体复合物100ns时长动力学的时候,每次任务都是中途停止,有时是40%停止,有时是90%停止,所以每次续跑很麻烦。

报错提示如下:
   Assertion failed:
   Condition:stat == cudasuccess
   Freeing of the device buffer failed. CuDA error #719 (cudaErrorLaunchFailure):
   unspecified launch failure.


  上网查了一下,有人说是GPU占用满了的问题,有人说是程序版本不兼容,也有人说是cuda版本的原因。
  所以想向论坛的大佬们请教一下,什么原因的可能性最大。


鄙人电脑配置如下:
   显卡:RTX 4070Ti super 16GB;   CPU:intel i7-14700KF   内存:32GB
   Gromacs version: 2024.04     显卡驱动版本:550.120   Cuda 版本:12.4    python version: 3.10.12
   模拟体系:加上水分子在内,大概30000个原子大小
所有操作都是在Ubuntu22.04环境下进行,且未同时运行其它任何大型程序。
   谢谢大家
  

作者
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FrancisCho    时间: 2025-1-22 07:58
同问,我遇到的是#700报错,一般是在跑第一步时就报错,所以我猜测我遇到的问题应该是体系结构有问题
作者
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Seyilaxa    时间: 2025-1-22 12:20
可以先试试更新显卡驱动和CUDA版本,还有问题的话再换个gromacs跑跑看
作者
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Huschein    时间: 2025-1-22 21:38
GMX2024的几个版本似乎CUDA都有点问题,可以换版本试试
作者
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Soulmate    时间: 2025-1-22 22:31
Seyilaxa 发表于 2025-1-22 12:20
可以先试试更新显卡驱动和CUDA版本,还有问题的话再换个gromacs跑跑看

好的,谢谢你,我试试
作者
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Soulmate    时间: 2025-1-22 22:31
Huschein 发表于 2025-1-22 21:38
GMX2024的几个版本似乎CUDA都有点问题,可以换版本试试

好的,那我换成2023版,谢谢你的建议
作者
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Soulmate    时间: 2025-1-22 22:32
FrancisCho 发表于 2025-1-22 07:58
同问,我遇到的是#700报错,一般是在跑第一步时就报错,所以我猜测我遇到的问题应该是体系结构有问题

这个我也不太清楚,而且咱俩的报错代码不一样,期待有大佬解答
作者
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喵星大佬    时间: 2025-1-26 01:33
Intel的14代问题
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Soulmate    时间: 2025-1-26 20:56
喵星大佬 发表于 2025-1-26 01:33
Intel的14代问题

请问大佬为什么会是英特尔14代处理器的问题呢,小弟想多了解点,请大佬赐教
作者
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13277552957    时间: 2025-3-31 11:25
FrancisCho 发表于 2025-1-22 07:58
同问,我遇到的是#700报错,一般是在跑第一步时就报错,所以我猜测我遇到的问题应该是体系结构有问题

我之前遇到过类似问题,确实是体系或者mdp文件设置的问题,猜测因该是有分子重叠导致的能量爆炸,内存溢出。重新建模和修改参数后问题消失
作者
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tptp    时间: 2025-4-1 07:43
遇到过,的确有可能是体系的问题,不要以为这个就纯粹是硬件问题。可以先检查检查体系,看看模拟中断时输出的PDB文件结构。




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