计算化学公社

标题: cp2k隐式溶液模型的AIMD计算非常慢 [打印本页]

作者
Author:
longyp    时间: 2025-1-21 18:07
标题: cp2k隐式溶液模型的AIMD计算非常慢
本帖最后由 longyp 于 2025-1-21 18:10 编辑

使用cp2k隐式溶剂模型进行AIMD计算,但是计算速度非常慢(三天才45 fs),使用的XY周期性,水溶液隐式溶剂用的都是Multiwfn生成的默认参数,请问有什么参数调整可以加快计算速度吗?

作者
Author:
Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2025-1-21 18:57
体系怎么长这样,实在不合理。如果是要跑固体表面钠、钾、氯、氢氧根离子的水溶液体系的AIMD,显然隐式溶剂模型不足以表现溶剂水分子与固体、与离子的相互作用,必须建模时就添加足够的显式水分子。另外溶液层没必要这么厚,毕竟AIMD模拟时间有限、温度又不高,靠近上边的溶液里的离子多半来不及扩散到靠近固体表面的区域参与反应,留在体系里徒增计算耗时。另外层状CoO(OH)有这么多钴原子的话,最好确认一下体系总自旋多重度是不是1。
(, 下载次数 Times of downloads: 2)

作者
Author:
longyp    时间: 2025-1-21 19:55
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-1-21 18:57
体系怎么长这样,实在不合理。如果是要跑固体表面钠、钾、氯、氢氧根离子的水溶液体系的AIMD,显然隐式溶剂 ...

好的,谢谢。那还是减少溶液厚度用显示水溶液试试看
作者
Author:
ljh123    时间: 2025-1-21 21:58
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-1-21 18:57
体系怎么长这样,实在不合理。如果是要跑固体表面钠、钾、氯、氢氧根离子的水溶液体系的AIMD,显然隐式溶剂 ...

您好,请问下水溶液中放几个氢氧根离子,这样是可以在一定程度上体现碱性环境吗?
作者
Author:
sobereva    时间: 2025-1-22 13:24
ljh123 发表于 2025-1-21 21:58
您好,请问下水溶液中放几个氢氧根离子,这样是可以在一定程度上体现碱性环境吗?

可以
完全不知道你想模拟什么。如果固液界面体系,通常应当用三维周期性,并且溶剂、溶质、slab占满整个盒子
当前盒子Z方向尺寸那么大,再加上结构古怪、用SCCS模型时本来SCF就容易难收敛,能不慢才怪





欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3