计算化学公社

标题: 求助IRC计算后曲线近似对称? [打印本页]

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QixyJason    时间: 2025-1-21 23:49
标题: 求助IRC计算后曲线近似对称?
请教一下各位老师同学:
1.我找到的过渡态振动方向符合产物的形成,所以我进行了IRC计算,但是发现得到的曲线近乎对称,然后就没有办法取某一端的结构进行中间体的结构优化,一般来讲IRC计算之后曲线的一端应该会得到产物的构型的,但是计算之后并没有得到,请求解答这种问题应该如何解决?(l的压缩包里是输出文件和IRC)
2.我还遇到了这样的情况,根据文献大的结构,过渡态和IRC都正常,但是优化中间体的时候输出文件只有两个YES,该如何解决?(另一份压缩包)
作者
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AndrewX    时间: 2025-1-22 09:02
1、过渡态找错了,表面上看像是羟基氢原子的转移过渡态,但只是像而已。
2、从起始结构到最后一帧结构,变化非常大,现在不是只有两个YES不收敛的问题,而是你确定这是你要的结构吗?
作者
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QixyJason    时间: 2025-1-22 18:59
AndrewX 发表于 2025-1-22 09:02
1、过渡态找错了,表面上看像是羟基氢原子的转移过渡态,但只是像而已。
2、从起始结构到最后一帧结构,变 ...

老师那我再去找找过渡态,第二个问题那个带氯的结构是一种催化剂,好像回帖发不了压缩包,我发到下面了老师,我是取的TS-Cl-00-irc的最后一点做的中间体优化的,目前这是第一步的过渡态,然后不收敛。整体反应应该是两步,但是第二步含氯的催化剂是否参与反应还有待计算验证一下,最后想要得到的结构是压缩包当中TS02的类似结构

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QixyJason    时间: 2025-1-22 19:06
QixyJason 发表于 2025-1-22 18:59
老师那我再去找找过渡态,第二个问题那个带氯的结构是一种催化剂,好像回帖发不了压缩包,我发到下面了老 ...

老师我现在找第二步的过渡态很迷茫,是否可以利用TS02的输出结构去调整类似体系的结构,类似体系的第二步可能就是加上了催化剂而已。初学者能否利用这样的思想规律去找过渡态




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