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标题: 怎样以合理的计算量衡量潜在的COF大环内侧链相互作用 [打印本页]

作者
Author: lemon_electron 时间: 2025-1-26 17:35
标题: 怎样以合理的计算量衡量潜在的COF大环内侧链相互作用
各位老师好：

学生最近在研究一个COF不同侧链取代基调控荧光性质的体系，近期一些实验在数据上有进展，在量化机理解释上碰到了一些问题，想请各位老师提一些建议：

如下图所示，我们做的是调控COF环侧链上的功能基团（即下图中的R）取代。初步的研究中，计算了各样品的COF片段的TDDFT并进行了比较，发现一些样品不管是波长还是PL强弱都能解释比较好，但在一些样品中也出现了反例，看文献推测，这些用片段TDDFT结果解释不了的样品所携带的取代基，自身（R自身）存在一定的可能产生空间共轭。因此我们推测，是否在COF大环内存在这些取代基的空间共轭效应呢？因此想把整个环当成整体进行一些基态和激发态的计算。

但由于整个体系比较大，带有取代基的整个大环存在600+原子，直接采用常见理论级别不太现实。虽然整个大环理论上存在C6h的对称性，但取代基存在的情况下经常会把对称性跑没，所以高斯的对称性加速也没起作用（已加上symm=loose的关键词以及高精度积分格点，未带弥散函数），我最终的目的是拿到整个大环的基态分子轨道，以及激发态的空穴—电子分布，我想了如下的方案不知道是否合理：

ORCA中采用3c方法对整个大环进行优化，用RI-wB97X-D3/def2-SV(P)算单点，再基于该轨道做sTD-DFT；
或者直接用RI-wB97X-D3/def2-SV(P)进行大环优化，再进行sTD-TDDFT计算。
（高精度片段结合“粗放式”大环进行说明）

希望各位老师提一些建议以及更合理的手段，感谢各位不吝赐教！

作者
Author: sobereva 时间: 2025-1-27 14:18
3c方法多了去了，下文就列举了不少，诸如HF-3c和wB97X-3c精度有天壤之别，要把问题交代得毫无歧义
盘点Grimme迄今对理论化学的贡献
http://sobereva.com/388（http://bbs.keinsci.com/thread-6662-1-1.html）

单点和激发态计算的级别可以

作者
Author: lemon_electron 时间: 2025-1-27 15:34
本帖最后由 lemon_electron 于 2025-1-27 15:37 编辑

sobereva 发表于 2025-1-27 14:18
3c方法多了去了，下文就列举了不少，诸如HF-3c和wB97X-3c精度有天壤之别，要把问题交代得毫无歧义
盘点Gri ...

谢谢sob老师回复！抱歉没说清楚，我原来想说的是先用B97-3c进行大环整体优化，再接着用RI-wB97X-D3/def2-SV(P)算单点，再接sTD-DFT，想着可以省一些计算量

作者
Author: agent99 时间: 2025-1-28 01:24
借楼问一下，为何选择sTD-DFT而不是TDA？

作者
Author: lemon_electron 时间: 2025-1-28 10:06
本帖最后由 lemon_electron 于 2025-1-28 10:11 编辑

agent99 发表于 2025-1-28 01:24
借楼问一下，为何选择sTD-DFT而不是TDA？

谢谢老师回复！我之前看sob老师帖子提到过，sTD会比TDA一定程度上避免一些问题；

TDA-DFT虽然激发能算得和TDDFT基本一样，但是算的振子强度和转子强度烂，于是Grimme后来提出了sTD-DFT，即把sTDA的思想直接用在TDDFT上来避免那些问题，耗时并没增加多少。（http://sobereva.com/388 盘点Grimme迄今对理论化学的贡献）

我这个地方用TDA会更合适吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-1-28 12:11
当前计算对这样的体系用TDA根本算不动，耗时没比TDDFT低多少
分清楚TDA、sTD、sTDA

作者
Author: lemon_electron 时间: 2025-1-28 12:50

sobereva 发表于 2025-1-28 12:11
当前计算对这样的体系用TDA根本算不动，耗时没比TDDFT低多少
分清楚TDA、sTD、sTDA

明白了，谢谢sob老师！

我之前说的这种理论级别够用吗？

先用B97-3c进行大环整体优化，再接着用RI-wB97X-D3/def2-SV(P)算单点，再接sTD-DFT；
（之前没把3c方法交代清楚）

作者
Author: sobereva 时间: 2025-1-28 15:18

lemon_electron 发表于 2025-1-28 12:50
明白了，谢谢sob老师！

我之前说的这种理论级别够用吗？

可

作者
Author: lemon_electron 时间: 2025-1-28 17:00

sobereva 发表于 2025-1-28 15:18
可

收到，谢谢sob老师

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