计算化学公社

标题: 第一次用超算计算高斯，由于对linux系统下高斯操作不熟悉导致报错，恳求大家帮助 [打印本页]

作者
Author: wang011127 时间: 2025-1-31 11:22
标题: 第一次用超算计算高斯，由于对linux系统下高斯操作不熟悉导致报错，恳求大家帮助
老师们好。我刚接触linux和高斯不久，先是在windows下用g09尝试了计算，对于该体系是可以进行计算的，但由于对于linux了解不深，在超算平台提交时遇到了一些问题，希望大家给予一些指导，非常感谢！

这个是我的gjf输入文件，名称为1.gjf，我不太清楚是否存在问题
# opt freq b3lyp/6-311g(d) geom=connectivity

Title Card Required

0 1
C                -1.03643527 3.25587405 1.83444553
C                -2.20775158 3.67634286 1.24698122
C                -2.66581955 3.06132777 -0.09983682
C                -1.87148320 2.12105148 -0.63717067
C                -0.57203588 1.73462896 -0.05735341
C                -0.14467619 2.20088428 1.12895720
C                -2.03147643 1.24324449 -1.86541828
O                -1.00781120 0.20091572 -1.83888718
C                0.09585111 0.78213044 -1.06278602
C                0.93936226 -0.30682570 -0.37411812
C                1.55642827 -1.22974627 -1.44137964
C                2.39993941 -2.31870241 -0.75271174
C                3.01700542 -3.24162298 -1.81997326
O                -2.91347827 1.37964772 -2.75256961
H                -0.73836823 3.66030690 2.77916247
H                -2.80456071 4.42658974 1.72221640
H                -3.57470012 3.36614485 -0.57515006
H                0.77326059 1.86444729 1.56381603
H                0.72909748 1.35339092 -1.70897524
H                1.72047298 0.15328420 0.19426989
H                0.31558679 -0.88229797 0.27752275
H                0.77531755 -1.68985617 -2.00976765
H                2.18020373 -0.65427400 -2.09302052
H                3.18105013 -1.85859251 -0.18432374
H                1.77616395 -2.89417469 -0.10107087
H                3.60308135 -3.99823537 -1.34148323
H                2.23589471 -3.70173289 -2.38836127
H                3.64078089 -2.66615071 -2.47161414

使用g16 < 1.gjf进行提交后出现以下报错
(, 下载次数 Times of downloads: 2)

希望大家可以给予一些帮助，感谢！

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-1-31 11:37
把geom=connectivity删掉，因为当前分子结构后面没有连接性关系表，Gaussian读不到会报错。另外建议#改成#P方便检查计算过程，如果还有其他类型错误可以参考http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html来解决。

作者
Author: wang011127 时间: 2025-1-31 18:15

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-1-31 11:37
把geom=connectivity删掉，因为当前分子结构后面没有连接性关系表，Gaussian读不到会报错。另外建议#改成#P ...

非常感谢，花了一下午的时间学习了这篇文章，目前已经可以顺利计算任务了！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)