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标题: 一个到达小分子RMSD阈值自动终止Gromacs模拟的小脚本 [打印本页]

作者
Author: James-Li7571 时间: 2025-1-31 11:33
标题: 一个到达小分子RMSD阈值自动终止Gromacs模拟的小脚本
本帖最后由 James-Li7571 于 2025-2-1 17:54 编辑

其中，默认tpr名为md.tpr,输出名为md.xtc,RMSD阈值为0.9，检测间隔为20s，RMSD参考组为4，计算组为13，如不是可自行在脚本中修改
准备好md.tpr文件后直接使用bash运行脚本即可

https://doi.org/10.5281/zenodo.14768647

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