计算化学公社

标题: 小作坊作品ChemCrackX的功能展示 [打印本页]

作者
Author: Hugo_314cat 时间: 2025-2-5 21:03
标题: 小作坊作品ChemCrackX的功能展示
本帖最后由 Hugo_314cat 于 2025-2-8 10:40 编辑

ChemCrackX是个人在2024年2月份开始的一个综合性计算化学辅助工具包，旨在用尽量少的人力去做尽量多的活儿。目前CCX还在不断地开发和调试当中。

第一篇浅试一下用ChemCrackX对小体系生成CI点结构瞎猜

case1: 环丁二烯->金字塔烷：分别对环丁二烯和金字塔烷做结构生成后进行CI结构初猜
(, 下载次数 Times of downloads: 23)

case2: 苯->盆苯: 分别对苯和盆苯做结构生成后进行CI结构初猜
(, 下载次数 Times of downloads: 24)

case3: 丙烯->丙烯 (1,3-氢迁移): 分别对迁移前和迁移后的丙烯做结构生成后进行CI结构初猜
(, 下载次数 Times of downloads: 24)

case4: Z-己三烯的顺式环化: 分别对Z-己三烯和环己二烯做结构生成后进行CI结构初猜
(, 下载次数 Times of downloads: 25)

我个人不是做CI的，也不知道结果的好坏，属于是纯乐子。不过看结构还挺好看的。

第二篇用ChemCrackX快速进行构象分析

ChemCrackX是非常适合对有机分子进行构象分析的，一般在几十秒内就能给出相当令人满意的结果，而且可以直接在ChemDraw画好后复制SMILES作为输入，非常的方便。下面给出一些例子：
己烷, 1.012s
(, 下载次数 Times of downloads: 23)
顺式十氢化萘, 1.924s
(, 下载次数 Times of downloads: 26)
一个具有A(1,3)相互作用的分子, 1.556s
(, 下载次数 Times of downloads: 26)
反式5并7环系, 1.923s
(, 下载次数 Times of downloads: 23)
顺式5并7环系，2.162s
(, 下载次数 Times of downloads: 25)
ChemCrackX不仅可以进行构象搜索，还能联用其内置的指令一站式将这些分子导出成任意格式，从而省去很多不必要的操作。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)