计算化学公社

标题: 求助：VMD Linux版本Tachyon渲染轨迹不清晰 [打印本页]

作者
Author: 含光君 时间: 2025-2-7 15:45
标题: 求助：VMD Linux版本Tachyon渲染轨迹不清晰
各位老师好，

我最近使用Linux版本渲染模拟轨迹，发现所得视频文件很糊。经检查发现Linux版本渲染轨迹默认使用的Tachyon命令为

usr/local/lib/vmd/tachyon_LINUXAMD64 xxx.dat -format PPM -o xxx.ppm

复制代码

这种情况下似乎没法把 -aasamples -mediumshade等渲染参数加进去，导致渲染效果一般，对此有什么好的解决办法在Linux版本的vmd渲染高质量轨迹？

社长培训中提到可自行将渲染图片使用ffmpeg命令合并成视频，但这应该要写个tcl脚本将每帧批量渲染出来，不知道可不可行

作者
Author: snljty2 时间: 2025-2-7 17:35
你后面说的方法应该是标准做法。
先在VMD里执行这个.tcl脚本：

set nframes [molinfo top get numframes]
set stepsize 10
for {set i 0} {$i < $nframes} {incr i $stepsize} {
animate goto $i
render Tachyon [format {%04d.dat} [expr $i / $stepsize]]
}

复制代码

然后退出VMD，将tachyon_LINUXAMD64所在路径加入PATH，执行诸如这样的shell脚本

nthread=$(($(lscpu | grep 'Core(s) per socket:' | awk -F ':' '{print int($2)}')*$(lscpu | grep 'Socket(s):' | awk -F ':' '{print int($2)}')))
for i in `ls -1 *.dat`; do
echo Processing $i ...
tachyon_LINUXAMD64 $i -format BMP -o ${i%\.*}.bmp \
-trans_raster3d -res 1500 1500 -mediumshade -aasamples 24 -numthreads ${nthread}
done

复制代码

然后加载ffpmeg，执行诸如

ffmpeg -start_number 0 -r 12 -v verbose -i '%04d.bmp' trajectory.mp4

复制代码

即可。

作者
Author: 含光君 时间: 2025-2-8 10:26

snljty2 发表于 2025-2-7 17:35
你后面说的方法应该是标准做法。
先在VMD里执行这个.tcl脚本：

哇，谢谢大佬，学习了

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-2-8 11:11

snljty2 发表于 2025-2-7 17:35
你后面说的方法应该是标准做法。
先在VMD里执行这个.tcl脚本：

你好，我想借楼问两个小问题。一，Tachyon渲染时如果mediumshade感觉不够，但又不想要fullshade产生的杂乱的原子阴影，有没有别的设置可以采用？二，这里ffmpeg指令没指定像素和视频的编码格式，产生的.mp4应该如何打开呢，我看这篇博客有提到windows可能无法播放默认输出的视频。

作者
Author: snljty2 时间: 2025-2-8 11:50

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-2-8 11:11
你好，我想借楼问两个小问题。一，Tachyon渲染时如果mediumshade感觉不够，但又不想要fullshade产生的杂 ...

你好，第一个问题我不太熟悉，或许可以试试

-fullshade -shadow_filter_off

复制代码

？第二个问题，我没试过Windows自带的播放器，如果有编码问题就尝试你链接中的选项即可。我平常是用PotPlayer 64 bit版本播放视频，libx264，libx265之类的应该都可以播放，没有遇到过这个问题（或许需要第一次看的时候选择下载一个解码器插件？）。

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-2-8 21:40

snljty2 发表于 2025-2-8 11:50
你好，第一个问题我不太熟悉，或许可以试试？第二个问题，我没试过Windows自带的播放器，如果有编码问题 ...

-shadow_filter_off在帮助里的说明是Transparent objects do not cast shadows，对于不透明的原子并不生效。如果Tachyo不能像POV-Ray那样设置无影灯的话，还是用回mediumshade好了。

播放器的问题再说吧，其实我还是用.gif格式多一点。

另外多说两句，2楼的第一个脚本可以轻松自定义始末帧和跨步，比那个内置的Movie Maker方便多了。我曾经尝试过用Movie Maker录制轨迹前一小段，结果发现中途点按钮Abort除了停止运行，还会自动清理所有已经生成的文件，没法保留需要的部分。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)