计算化学公社

标题: 怎么应用Amber14SB对聚合物优化 [打印本页]

作者
Author: milk_q 时间: 2025-2-10 20:47
标题: 怎么应用Amber14SB对聚合物优化
求助一下大家怎么应用Amber14SB力场，对聚合物结构进行分子力学结构优化处理然后再使用Sobtop 1.0程序构建聚合物的力场参数

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-10 21:45
搞清楚力场的基本特征再用
AMBER是蛋白质力场，拿它算聚合物做什么
认真看http://sobereva.com/soft/Sobtop/#FAQ2里关于AMBER和GAFF关系的说明
基于sobtop创建的GAFF力场的拓扑文件，用gromacs做能量极小化即可达到目的

作者
Author: 18217265596 时间: 2025-2-13 09:50
14SB是蛋白力场你用来做什么聚合物？

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)