计算化学公社

标题: V-rescale被质疑系综不正确 [打印本页]

作者
Author:
二分音符    时间: 2025-2-14 00:27
标题: V-rescale被质疑系综不正确
最近投稿被审稿人质疑V-rescale热浴无法得到准确系综,而且本组几乎每次投稿都会被问热浴的问题,但是对比nose-hoover结果基本都是一致的。疑惑的地方是,为什么很多热统领域研究者会质疑V-rescale呢?

根据Parrinello文章 (JCP 126, 014101)的描述,V-rescale可以产生正确的NVT系综,并且结果和nose-hoover等一致,Gromacs的manual也提到“This thermostat is similar to Berendsen coupling, with the same scaling using tau-t, but the stochastic term ensures that a proper canonical ensemble is generated.”

是否是因为gromacs采用的V-rescale虽然加入了随机项解决了系综问题,但是名字容易让人误以为是更早期的velocity rescale?如果是这个原因的话,以后methods部分就干脆强调这个区别好了。

作者
Author:
sobereva    时间: 2025-2-14 02:51
可能是误以为用的原始的速度调节法。可以每次除了引用V-rescale原文外,还同时写一两句话提及选择这个热浴的理由,免得被问。
作者
Author:
二分音符    时间: 2025-2-14 12:35
sobereva 发表于 2025-2-14 02:51
可能是误以为用的原始的速度调节法。可以每次除了引用V-rescale原文外,还同时写一两句话提及选择这个热浴 ...

谢谢社长
作者
Author:
fhh2626    时间: 2025-2-14 13:22
因为V-rescale这个名称是错误的,传统velocity rescaling就是得不到正确的系综。

而你用的方法应该叫Bussi-Donadio-Parrinello thermostat或者stochastic velocity rescaling
作者
Author:
二分音符    时间: 2025-2-14 13:26
fhh2626 发表于 2025-2-14 13:22
因为V-rescale这个名称是错误的,传统velocity rescaling就是得不到正确的系综。

而你用的方法应该叫Bus ...

有道理,以后换名称




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3