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标题: 展示一下使用ChemCrackX借助GIMIC程序进行ACID等值面绘图的效果 [打印本页]

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Hugo_314cat    时间: 2025-2-14 18:35
标题: 展示一下使用ChemCrackX借助GIMIC程序进行ACID等值面绘图的效果
ChemCrackX是个人在2024年2月份开始开发的一个综合性计算化学辅助工具包,旨在用尽量少的人力去做尽量多的活儿。目前CCX还在不断地开发和调试当中。

关于GIMIC的说明详见Sobereva老师撰写的博文《考察分子磁感生电流的程序GIMIC 2.0的使用(含24分钟演示视频)http://sobereva.com/491
关于AICD函数的说明详见Sobereva老师撰写的博文《使用AICD程序研究电子离域性和磁感应电流密度》http://sobereva.com/147

因特殊保密原因,恕不对该功能的细节和实现过程作任何解释,也不对该功能的类似/衍生功能进行展示。这里展示一些芳香性分子(苯、环丙烷)与反芳香性分子(环丁二烯、环丁烷)的ACID函数的等值面图像效果。理论上可以将AICD数据导出为*.cube文件,但还没来得及做,因为我现阶段用不上。ACID函数的等值面为0.002。

有一个点我挺想吐槽的:这个函数一会儿叫ACID,一会儿又叫AICD;原文章(Chem. Rev. 2005, 105 (10), 3758–3772)里面函数全称首字母连一起是AICD,但他给的缩写又是ACID,没想明白是为什么。

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wal    时间: 2025-2-14 21:31
没有环电流方向吗?感觉这个是AICD的灵魂
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Hugo_314cat    时间: 2025-2-14 23:33
wal 发表于 2025-2-14 21:31
没有环电流方向吗?感觉这个是AICD的灵魂

实在不好意思,关于这个事儿我可能得等几个月后才能够专门开个帖子聊一聊拙见。
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clc121    时间: 2025-3-17 09:39
麻烦问下楼主及各位大神,到底应该写 AICD还是ACID才不会让审稿人 挑刺?(虽然大部分审稿人觉得都可以,但是应该会有那么一小撮。。。)
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Hugo_314cat    时间: 2025-3-21 12:16
clc121 发表于 2025-3-17 09:39
麻烦问下楼主及各位大神,到底应该写 AICD还是ACID才不会让审稿人 挑刺?(虽然大部分审稿人觉得都可以,但 ...

Geuenich, D.; Hess, K.; Köhler, F.; Herges, R. Anisotropy of the Induced Current Density (ACID), a General Method To Quantify and Visualize Electronic Delocalization. Chem. Rev. 2005, 105 (10), 3758–3772. https://doi.org/10.1021/cr0300901.

看这篇文章的标题,他写的简称是ACID。我也只能尊重原作者了。




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