计算化学公社

标题: 求助：关于粗略预测有机分子荧光吸收和发射波长 [打印本页]

作者
Author: he1792339704 时间: 2025-2-19 12:29
标题: 求助：关于粗略预测有机分子荧光吸收和发射波长
大神们好，由于我没有怎么接触过计算领域，所以懂得不多，大神们觉得问题低级还请轻喷。步入正题：
我目前想做一个探测型的探针，也即该探针会对特定物质进行响应，响应前和响应后是一个化学平衡，且都知道它们的有机结构，我想预测一下反应前后它们的吸收发射波长，以做一个实验前的类似于预实验的事情，这样做实验就能进一步验证，但是我的笔记本貌似连6-31G*都跑不出来（昨天晚上跑了一晚上没出结果，该体系相对来说较大），不知道各位大神有什么建议吗？对于预测荧光吸收和发射波长，有没有什么方法对算力需求不是很大而且又能有一定预测的精度？
另外，据我调研，现在大多文献中都是算的HOMO和LUMO之间的能隙差，之前sob大神和别的大神都已经说过该方法的不准确性，而且该方法或许只能预测红移和蓝移（而无法预测准确波长？）然而有的文章直接得到了吸收波长，与实测貌似还挺接近。
还请各位大神指导，谢谢！

作者
Author: tonganlhy 时间: 2025-2-19 12:52
6-31G*一晚上笔记本都跑不出来还是算了吧。要么找服务器跑，要么查文献看看有没有类似结构预测一下。

作者
Author: he1792339704 时间: 2025-2-19 12:53

tonganlhy 发表于 2025-2-19 12:52
6-31G*一晚上笔记本都跑不出来还是算了吧。要么找服务器跑，要么查文献看看有没有类似结构预测一下。

谢谢您的回答

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-19 13:36
“有的文章直接得到了吸收波长，与实测貌似还挺接近” 这种瞎猫碰上死耗子的事不值得一提

算的什么体系也不说、具体输入文件也不给，别人没法给出准确的指导意见

图非常便宜用ZINDO，或者sTDA-xTB，笔记本也能算得动大几百原子的电子光谱。也可以考虑用更好的、ORCA直接支持的sTDA或sTDDFT，耗时基本等同于杂化泛函算基态单点的耗时。北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/KAQC）详细讲了sTDA-xTB、sTDA和sTDDFT的原理和具体用法。

作者
Author: he1792339704 时间: 2025-2-19 15:52

sobereva 发表于 2025-2-19 13:36
“有的文章直接得到了吸收波长，与实测貌似还挺接近” 这种瞎猫碰上死耗子的事不值得一提

算的什么体系 ...

感谢sob老师的回复，我计算的体系是一个荧光分子，不算很大，总共五六十个原子，都是C、N、O等一二周期的原子，因为不知道怎么放图片我只好口头叙述了。我是用windows的高斯16算的，
%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\gausswork\ph\ph_3.chk
%Mem=12GB
%NProcShared=15
# B3LYP/3-21G opt freq td(nstates=3,root=1,singlet)

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更改为这个小基组了还是算了半天没算完，实在是有些困惑

作者
Author: he1792339704 时间: 2025-2-19 15:55
附上我要算的体系：

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-19 17:35

he1792339704 发表于 2025-2-19 15:52
感谢sob老师的回复，我计算的体系是一个荧光分子，不算很大，总共五六十个原子，都是C、N、O等一二周期的 ...

拿3-21G计算毫无意义
买个（或租个）像样的服务器算，甭非要在个人机子上算耗时不低的任务，瞎耽误工夫
而且下文明确说了，别非要用Windows版Gaussian，白白浪费CPU性能
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

作者
Author: he1792339704 时间: 2025-2-19 17:44

sobereva 发表于 2025-2-19 17:35
拿3-21G计算毫无意义
买个（或租个）像样的服务器算，甭非要在个人机子上算耗时不低的任务，瞎耽误工夫
...

好的，谢谢sob老师

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