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标题: 求助基于静电势结果分析两成分间的非共价相互作用力 [打印本页]

作者
Author: 林森 时间: 2025-2-19 16:47
标题: 求助基于静电势结果分析两成分间的非共价相互作用力

化合物A：含有酰胺的接枝多糖阳离子单元（其中一个NH2形成酰胺，其中一个NH2质子化成为NH3+）；

化合物B：结构为两个稠合的杂环组成的阴离子（其中杂环上的N去质子化为N-）；

对两个结构优化并用Multiwfn计算得到两个化合物的静电势图。

结构A中（各极值点有正有负，其中羰基O处的静电势极值点为-56kcal/mol，羟基H处的静电势极值点为102kcal/mol，NH3+处极值点为165kcal/mol）；

结构B中（各个极值点均为负值，其中N-处的极值点为-5kcal/mol，NH上H处的极值点为-0.6kcal/mol，羟基O处的极值点为-4kcal/mol）

目标想通过两结构的静电势分析两者间的弱相互作用力，①请问是否可以分析结构A中羰基的O（-56kcal/mol）能否与结构B中NH处H（-0.6kcal/mol，结构中相对较大值）的氢键相互作用？②因结构B中各处极值点全为负值，如何分析B结构与结构A中负值处的相互作用？请各位老师赐教，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-19 17:41
直接把图摆出来。文字描述过于抽象

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