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标题: 请教大家在做周期性体系建模的时候有哪些功能是刚需？ [打印本页]

作者
Author: Hugo_314cat 时间: 2025-2-20 16:03
标题: 请教大家在做周期性体系建模的时候有哪些功能是刚需？
大家好，

最近我在为ChemCrackX编写关于周期性体系的代码，目前实现的功能如下：
*. 创建晶胞(给定六个晶胞参数)
*. 在晶胞中放入原子和分子（如图）
*. 求出晶胞中任意两原子的绝对距离
*. 创建超胞
*. 图示晶胞
*. 直接将晶胞信息用于创建CP2K输入文件

计划编写的功能有：
*. 判断晶体的成键形式以及是否是无限共价晶体
*. 将直角坐标形式的cube文件转换为晶格坐标的cube文件
*. 提取晶胞中的原子，团簇以及周围环境等
*. 在晶胞中进行原子的随机替换(模拟掺杂)

因为我不是做第一性原理的，所以我也不甚了解还有哪些操作/功能是比较繁琐却又很刚需的，故特来请教。谢谢大家！

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-2-20 16:14
切任意晶格指数的表面、调整表面暴露的“高度”并将盒子正交化应该可以算一个，http://bbs.keinsci.com/thread-5508-1-1.html有详细讨论，这对异质结构建很有意义。其他参考vaspkit和atomsk的功能吧，如果能比过M$那是更好了。

作者
Author: agent99 时间: 2025-2-21 03:36
检测对称性，如果有的话生成带对称性的新cif文件。

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