计算化学公社

标题: Genice 冰晶生成的问题请教 [打印本页]

作者
Author: xiaohaha2333 时间: 2025-2-20 22:37
标题: Genice 冰晶生成的问题请教
各位大佬老师们好，在用Genice生成冰晶结构时遇到了的报错问题，使用的代码是：genice ice1c -r 3 3 3 -f pdb --format pdb -w tip3p > "D:\Desktop\moudle\ice1c.pdb"
genice ice1c -r 3 3 3 -f gromacs --format gromacs -w tip3p > "D:\Desktop\moudle\ice1c.gro"

(, 下载次数 Times of downloads: 28) (, 下载次数 Times of downloads: 28) (, 下载次数 Times of downloads: 27)
文献说的很模糊：
(, 下载次数 Times of downloads: 28) (, 下载次数 Times of downloads: 27)

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-21 07:38
自行检查gro文件格式，如果没有问题，用最主流的VMD而非pymol看结构

提问的时候不要贴中文翻译，完全多余

那叫“命令”不叫“代码”，看
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html）

作者
Author: xiaohaha2333 时间: 2025-2-21 11:25

sobereva 发表于 2025-2-21 07:38
自行检查gro文件格式，如果没有问题，用最主流的VMD而非pymol看结构

提问的时候不要贴中文翻译，完全多 ...

好的谢谢老师指导

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)