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标题: 能不能用高斯软件做一个反应过程的静电势图? [打印本页]

作者
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chengzefeg    时间: 2025-2-24 14:11
标题: 能不能用高斯软件做一个反应过程的静电势图?
比如,溴乙烷与OH-反应生成乙醇和溴离子,反应物+过渡态+生成物,三者的静电势图,谢谢回答

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Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2025-2-24 14:44
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-2-24 14:52 编辑

“静电势图”描述不清晰,仔细阅读http://sobereva.com/298的第11节理清相关概念。如果是指http://sobereva.com/443介绍的图,应当完整描述为“静电势着色的范德华表面”。

你说的这个反应刚好在http://sobereva.com/598的2.3节里有一张动图,不过是IRI等值面的。可以参考http://sobereva.com/86http://sobereva.com/200,先找到过渡态、跑好IRC,再按http://sobereva.com/199将反应路径上的每个点都提取坐标,批量做Gaussian里的单点计算获得各帧的.fch(或.fchk)文件(记得开nosymm),再批量用Multiwfn计算获得各帧的静电势等数据,批量载入VMD渲染出各帧的图片,最后将所有图片用ffmpeg等软件合并为动图。

编辑:另外,单从目前描述看,这帖应当发到“波函数分析与Multiwfn”版块去。如果Gaussian和Multiwfn等研究工具还不太熟悉,需要入门计算化学的话,还请说明来意。

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sobereva    时间: 2025-2-24 15:35
别乱找地方发帖扰乱论坛秩序。当前问题明显不该发到“培训班相关”版块,这次给你移动了,下次直接删帖扣分处理




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