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标题: 求助统计氢键寿命的tcl脚本该如何去写 [打印本页]

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cuicuishark    时间: 2025-2-25 11:03
标题: 求助统计氢键寿命的tcl脚本该如何去写
我想统计水以氢键作为桥连接另外两个分子时,这种氢键的寿命情况,用gmx好像分析不了,写出了一个统计该氢键桥数量的脚本,但是对于氢键寿命如何统计没有思路,我把第一帧里形成氢键的原子记录下来然后看它们在下一帧形成氢键的情况,发现第二帧氢键数量为0

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sobereva    时间: 2025-2-25 11:40
氢键寿命的分析参考下文
J. Phys. Chem. B, 110, 4393 (2006)
J. Chem. Phys., 113, 10663 (2000)
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mol    时间: 2025-3-3 10:25
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