计算化学公社

标题: 我想寻找tip4p-d水模型，在哪里可以获取呢？ [打印本页]

作者
Author: wanwen 时间: 2025-2-25 18:49
标题: 我想寻找tip4p-d水模型，在哪里可以获取呢？
老师好，我想寻找tip4p-d水模型，在哪里可以获取呢？

作者
Author: k64_cc 时间: 2025-2-25 19:40
antechamber的dat里就有

作者
Author: wanwen 时间: 2025-2-25 20:11

k64_cc 发表于 2025-2-25 19:40
antechamber的dat里就有

不好意思，我不是很理解

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-26 12:29
根据相应文献里的参数自己改写GROMACS自带的水模型中的参数就完了
就算其它程序带了其参数，那也不是GROMACS的格式

作者
Author: wanwen 时间: 2025-3-5 16:01

sobereva 发表于 2025-2-26 12:29
根据相应文献里的参数自己改写GROMACS自带的水模型中的参数就完了
就算其它程序带了其参数，那也不是GROMA ...

你好老师，我想再请教下，如果我现在有opc.itp,我在ffnonbonded.itp里添加Lj势，然后改下tip4p.gro就可以了吗？改的这个tip4p.gro需要进行能量最小化么，如果需要是不是把.gro文件转换为.pdb文件，然后按照正常操作来就行，

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-6 02:20

wanwen 发表于 2025-3-5 16:01
你好老师，我想再请教下，如果我现在有opc.itp,我在ffnonbonded.itp里添加Lj势，然后改下tip4p.gro就可以 ...

根本不需要改gro文件

作者
Author: zzvion 时间: 2025-3-26 22:58
autoff不知道可以实现吗

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