计算化学公社

标题: 如何设置盒子振荡变形 [打印本页]

作者
Author:
kijsan    时间: 2025-2-25 23:20
标题: 如何设置盒子振荡变形
有的文献研究液体的粘弹性,模拟了盒子的振荡变形情况,如下图所示。gromacs中可以进行类似的设置吗?
目前会用deform模块设置盒子按恒定速率进行变形。类似这种振荡变形的模拟应该如何设置呢?
希望各位老师指点一下。
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作者
Author:
sobereva    时间: 2025-2-26 12:35
GROMACS里没法直接设置,只能自己写shell脚本反复自动修改mdp的deform设置并续跑来实现




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