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标题: 求助计算阳离子自由基过程中任务总掉，已尝试B3LYP和M062X两个泛函 [打印本页]

作者
Author: Di20215639 时间: 2025-3-3 15:32
标题: 求助计算阳离子自由基过程中任务总掉，已尝试B3LYP和M062X两个泛函
本帖最后由 Di20215639 于 2025-3-4 13:13 编辑

各位老师好，
目前我在计算基于过度拥挤乙烯结构的一个阳离子自由基过程中始终报错（或者是计算程序无法继续运行）。已经尝试过B3LYP和M062X两个泛函，都是没计算完成。使用B3LYP的时候出现以下的问题。后续改为M062X泛函以后，任务还是会掉。两次计算时候都是opt和freq一起计算的。

所以我现在的问题是需要把opt和freq分开计算吗？还是选用其他的泛函

作者
Author: lemon_electron 时间: 2025-3-3 15:34
可能初始结构有问题，给个这个截图信息有点少了

作者
Author: sai77 时间: 2025-3-3 16:28
图片上的信息不是报错

作者
Author: Di20215639 时间: 2025-3-3 22:51

sai77 发表于 2025-3-3 16:28
图片上的信息不是报错

啊，但每次的任务都是会自己掉，每次都算不完。请问这个是什么原因导致的呢

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-3-3 22:54

Di20215639 发表于 2025-3-3 22:51
啊，但每次的任务都是会自己掉，每次都算不完。请问这个是什么原因导致的呢

请按http://sobereva.com/620将能复现问题的输入输出文件作为附件上传并详细描述计算目的，另外也可参考http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html一帖。

作者
Author: xsc6 时间: 2025-3-4 00:19
这不是报错，把输出文件传上来看看

作者
Author: Di20215639 时间: 2025-3-4 09:32

xsc6 发表于 2025-3-4 00:19
这不是报错，把输出文件传上来看看

log文件有点大，没法上传啊

作者
Author: Di20215639 时间: 2025-3-4 09:34

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-3-3 22:54
请按http://sobereva.com/620将能复现问题的输入输出文件作为附件上传并详细描述计算目的，另外也可参考h ...

好的。已经上传了输入文件，但输出的log有点大，上传不了。我就是想计算一下阳离子自由基的吸收光谱来分析氧化过程

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-3-4 09:55
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-3-4 10:28 编辑

Di20215639 发表于 2025-3-4 09:34
好的。已经上传了输入文件，但输出的log有点大，上传不了。我就是想计算一下阳离子自由基的吸收光谱来分 ...

可以按http://sobereva.com/672所说适当压缩以后再上传附件，实在不行用网盘分享也得。毕竟从输出文件可以判断问题在SCF不收敛（参考http://sobereva.com/61）、几何优化不收敛（参考http://sobereva.com/164，注意M06-2X做几何优化不太理想，由于http://sobereva.com/557的描述B3LYP可能也有问题）还是什么别的因素（参考http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html）。当前geom=connectivity和坐标后的连接性关系表都可以删除，除此之外单看关键词没啥问题。

另外，http://sobereva.com/543可能与研究目的相关，推荐阅读。

作者
Author: Di20215639 时间: 2025-3-4 13:14

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-3-4 09:55
可以按http://sobereva.com/672所说适当压缩以后再上传附件，实在不行用网盘分享也得。毕竟从输出文件可 ...

非常感谢您的回复，我把输入和输出文件放一起压缩上传了。

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-3-4 14:27
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-3-4 15:14 编辑

Di20215639 发表于 2025-3-4 13:14
非常感谢您的回复，我把输入和输出文件放一起压缩上传了。

这个输出前面的几何优化过程还行（要110步这么长才收敛，应该是特殊的电子结构碰上M06-2X的特性了），任务报错或者卡顿的原因在后面，大体系的振动分析确实是很消耗资源、很漫长的计算。能给更多内存就给，实在不行也尝试降低并行核数，然后耐心等待吧。（编辑：硬盘容量也得足够放scratch文件，参考http://bbs.keinsci.com/thread-33313-1-1.html）

作者
Author: Di20215639 时间: 2025-3-4 17:54

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-3-4 14:27
这个输出前面的几何优化过程还行（要110步这么长才收敛，应该是特殊的电子结构碰上M06-2X的特性了），任 ...

好的好的，非常感谢。因为我平时做计算比较少，看不太明白这个任务出现问题的原因，能麻烦您解释一下吗？那我后续把核数保持在24，内存增大到200G可以吗

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