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标题: 原子间距离分布计算结果中的纵坐标Probability应该怎么解释 [打印本页]

作者
Author: Ashinzy 时间: 2025-3-4 12:30
标题: 原子间距离分布计算结果中的纵坐标Probability应该怎么解释
本帖最后由 Ashinzy 于 2025-3-4 13:02 编辑

gmx distance -s md.tpr -f md400.xtc -select 'com of group E700_CA plus com of group U49_P' -n index.ndx -oh -len 0.7 -tol 0.6 -binw 0.05

请问用这个命令计算出来的展示原子间距离分布的xvg文件中的纵坐标Probability应该怎么向审稿人解释呀？如果是概率分布的话为什么range不是0-1呢？
xvg文件如图：

作者
Author: xyan11 时间: 2025-3-4 14:06
这个纵坐标是不是应该叫"概率密度"呀这个曲线下面积才是1吧

作者
Author: Ashinzy 时间: 2025-3-4 14:10

xyan11 发表于 2025-3-4 14:06
这个纵坐标是不是应该叫"概率密度"呀这个曲线下面积才是1吧

懂了懂了，太感谢啦

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