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标题: 为什么导入ovito的轨迹文件会缺少很多帧 [打印本页]

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Author: sysuhr 时间: 2025-3-4 21:56
标题: 为什么导入ovito的轨迹文件会缺少很多帧
我想问一下为什么导入ovito的轨迹文件会缺少很多帧，如图所示，文件大概是16个GB，但是只能识别出21帧结构，我觉得正常应该识别出来200多帧，我不知道这是为什么

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Author: liuyuje714 时间: 2025-3-5 10:42
本帖最后由 liuyuje714 于 2025-3-5 10:43 编辑

才200帧就这么大轨迹？你多少原子体系哇。另外有没有可能本来就只有21帧，你自己弄错了。

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Author: sysuhr 时间: 2025-3-5 15:44

liuyuje714 发表于 2025-3-5 10:42
才200帧就这么大轨迹？你多少原子体系哇。另外有没有可能本来就只有21帧，你自己弄错了。

我跑的是大模型，我每一帧的结构大概有70多万原子数；其他几个速度都很正常，只有这个速度有问题，我这个主要就是原子数太多了，70多万，他中间偷偷少一个原子，或者少一列我也看不出来

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Author: xyan11 时间: 2025-3-7 13:30
要不试试看在ovito里导出某一帧的lammps轨迹文件然后看看这一帧的轨迹文件有多大然后乘以21看看离16GB差多少

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Author: sysuhr 时间: 2025-4-17 16:43

xyan11 发表于 2025-3-7 13:30
要不试试看在ovito里导出某一帧的lammps轨迹文件然后看看这一帧的轨迹文件有多大然后乘以21看看离16GB差 ...

我其他速度都已经证明了代码及输出都没问题，这个问题已经解决，应该是做冲击的时候少了一部分原子，ovito在识别的过程中直接识别不出来了，但是做冲击的lammps还可以继续输出，就会有这样的问题了（不太确定）

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Author: 892259571 时间: 2026-3-11 23:19

sysuhr 发表于 2025-4-17 16:43
我其他速度都已经证明了代码及输出都没问题，这个问题已经解决，应该是做冲击的时候少了一部分原子，ovit ...

我现在也碰到这个问题了，请教一下楼主当时怎么解决的，应该也是缺少了某部分原子，然后原子序号不连续导致的ovito可视化出现问题

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