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标题: sobtop在生成top文件过程中调用openbabel时闪退 [打印本页]

作者
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凯亚    时间: 2025-3-6 21:45
标题: sobtop在生成top文件过程中调用openbabel时闪退
按照例5的生成聚合度为40的聚合物拓扑文件步骤的调用openbabel计算mmff94文件时闪退(已按提示更换了openbabel的实际路径),使用的mol2文件为例子提供的文件,现在不清楚是哪一步存在问题,请老师们解答!谢谢!

作者
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Lance先生    时间: 2025-3-6 22:03
上传一下必要的文件呢?
作者
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凯亚    时间: 2025-3-6 22:45
Lance先生 发表于 2025-3-6 22:03
上传一下必要的文件呢?

文件用的就是例子示范文件,已上传
作者
Author:
sobereva    时间: 2025-3-7 06:24
我这里没有任何问题
(, 下载次数 Times of downloads: 45)

在命令行下运行看报错提示
作者
Author:
凯亚    时间: 2025-3-7 13:20
sobereva 发表于 2025-3-7 06:24
我这里没有任何问题


运行报错提示好像是这样的,一运行特别快就闪退了
作者
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凯亚    时间: 2025-3-7 13:51
这是运行报错的提示,这是什么原因呢老师们,一运行就闪退
作者
Author:
凯亚    时间: 2025-3-7 17:05
sobereva 发表于 2025-3-7 06:24
我这里没有任何问题

报错的图片已经上传,提示貌似是什么文件找不到,老师这种情况一般是什么问题引起的
作者
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sobereva    时间: 2025-3-7 18:41
凯亚 发表于 2025-3-7 17:05
报错的图片已经上传,提示貌似是什么文件找不到,老师这种情况一般是什么问题引起的

确保openbabel版本用的和我的一样
并且把sobtop目录放到其它地方再试
也可以自己手动运行openbabel命令(与sobtop提示的命令相同)看是什么情况

作者
Author:
凯亚    时间: 2025-3-7 20:54
sobereva 发表于 2025-3-7 18:41
确保openbabel版本用的和我的一样
并且把sobtop目录放到其它地方再试
也可以自己手动运行openbabel命令 ...

好的,换了目录试了试可以运行了,谢谢老师
作者
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qyl    时间: 2025-5-21 11:20
同学,可以分享一下Linux系统的openbabel安装包吗?




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