计算化学公社
标题:
CP2K使用Dimer对CI-NEB寻找的过渡态进行矫正结构出现问题
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作者Author:
jifeng131381
时间:
2025-3-9 17:52
标题:
CP2K使用Dimer对CI-NEB寻找的过渡态进行矫正结构出现问题
本帖最后由 jifeng131381 于 2025-3-9 18:01 编辑
各位老师好,我计算了4CP在Pd上脱氯过渡态,先CI-NEB跑了一下,然后使用Dimer矫正CI-NEB过度态的结构,结果我跑了差不多四天Dimer后发现最新结构很离谱,不知是哪里的问题。
作者Author:
Hedonism
时间:
2025-3-9 20:38
可以把Dimer跑出来每一步的轨迹文件放到VMD里看看,可能是哪一步开始发生键长突变了
作者Author:
sobereva
时间:
2025-3-9 22:33
dimer运行过程中就要经常查看优化轨迹,跑飞了及时停止,哪能白浪费4天。
dimer能否受力收敛有时候严重取决于初始的dimer朝向,提供合理的初始朝向会令收敛更为顺利
北京科音CP2K第一性原理计算培训班(
http://www.keinsci.com/KFP
)里专门说了这点:
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