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标题: 进行nvt结冰模拟时，水分子结构不怎么运动，而是在自己的位置抖动，怎么办 [打印本页]

作者
Author: DespicablePeter 时间: 2025-3-14 11:20
标题: 进行nvt结冰模拟时，水分子结构不怎么运动，而是在自己的位置抖动，怎么办
老师好，我在类似于碳纳米管结构的石墨烯内放置了水分子，使用gromacs进行nvt模拟，温度控制在400K，模拟时长是1000ps。但是发现水分子运动不剧烈，只是在自己的位置抖动。在同样水分子数量情况下，我测试了不同轴向尺寸的石墨烯，发现情况类似。请问这是什么原因导致的？我将mdb文件图片，温度趋势图，还有动画附上了，请各位老师和同学们指点一下，谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-14 14:56
那叫mdp

水单独控温

作者
Author: DespicablePeter 时间: 2025-3-14 15:02

sobereva 发表于 2025-3-14 14:56
那叫mdp

水单独控温

好的，谢谢老师

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