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标题: Molclus做团簇最后isostat筛选的时候结构发生了出错 [打印本页]

作者
Author: 18367716590 时间: 2025-3-14 16:37
标题: Molclus做团簇最后isostat筛选的时候结构发生了出错
新手小白，想问一下这个如何解决

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-15 06:50
VMD读取多帧轨迹时根据第一帧的坐标判断成键关系。当前说明优化出来的不同团簇结构的成键关系不同。和traj.xyz里的初始结构（如原子间距离太近）、计算级别等设置都可能有关。你认为不靠谱的结构就忽略掉。并且看下文
谈谈VMD可视化程序的连接关系的判断和设置问题
http://sobereva.com/534（http://bbs.keinsci.com/thread-16396-1-1.html）

作者
Author: 18367716590 时间: 2025-3-17 20:52

sobereva 发表于 2025-3-15 06:50
VMD读取多帧轨迹时根据第一帧的坐标判断成键关系。当前说明优化出来的不同团簇结构的成键关系不同。和traj. ...

感谢sob老师的回复

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