计算化学公社

标题: cp2k aimd.inp计算问题，报错mm_xpmem.c:135 UCX ERROR [打印本页]

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Author: 生煎小馒头 时间: 2025-3-19 10:22
标题: cp2k aimd.inp计算问题，报错mm_xpmem.c:135 UCX ERROR
在集群上通过slurm调度系统运行了cp2k2022计算aimd.inp文件，系统是centos7.9版本，intelcpu，一个节点大概520G内存，跑了一个小时会出现以下报错，mm_xpmem.c:135 UCX ERROR failed to attach xpmem apid 0x340000184c offset 0x169a3000 length 16384: Cannot allocate memory，目前实在是找不到原因所在，问问吧友，有遇见这种情况吗，下面是我的aimd.inp文件，提交作业的输入文件:cp2k-2022.sh,输出日志：out.log，输出日志有点过大，上传不了，只能截个图 (, 下载次数 Times of downloads: 1)

作者
Author: Santz 时间: 2025-3-19 10:46
附上你的den1.2.xyz

作者
Author: highlight 时间: 2025-3-19 11:39
你申请48核mpi跑64进程？

作者
Author: 生煎小馒头 时间: 2025-3-19 12:31
(, 下载次数 Times of downloads: 4)

作者
Author: 生煎小馒头 时间: 2025-3-19 12:31

Santz 发表于 2025-3-19 10:46
附上你的den1.2.xyz

您好，我已附上该文件，能帮我看看吗

作者
Author: 生煎小馒头 时间: 2025-3-19 12:33

highlight 发表于 2025-3-19 11:39
你申请48核mpi跑64进程？

疏忽了，我已重新运行了，还是会出现以上报错

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-19 13:45
这是论坛，不是（很low的）贴吧，不要用“吧友”称呼

置顶的社员必读贴明确说了，过大的文本文件压缩后再上传，还超标传网盘。没output.log没法判断。贴当前截图里这些根本不是CP2K自己输出的信息没意义

作者
Author: 生煎小馒头 时间: 2025-3-19 14:13

sobereva 发表于 2025-3-19 13:45
这是论坛，不是（很low的）贴吧，不要用“吧友”称呼

置顶的社员必读贴明确说了，过大的文本文件压缩后 ...

谢谢社长提醒，百度链接已附上通过网盘分享的文件：cp2k
链接: https://pan.baidu.com/s/10eMU77RXWuT1RlCUDMx3yw?pwd=usi8 提取码: usi8
--来自百度网盘超级会员v3的分享

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Author: sobereva 时间: 2025-3-19 14:38
输出信息没有问题。大概率是内存泄漏（编译问题，或者软件环境问题如活动的MPI库和编译时用的不一致），导致最后内存不够

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Author: Santz 时间: 2025-3-19 17:05
本帖最后由 Santz 于 2025-3-19 20:31 编辑

生煎小馒头发表于 2025-3-19 12:31
您好，我已附上该文件，能帮我看看吗

编译问题，我用 2022.2 跑了几个小时，正常完成计算。 aimd.out

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Author: 生煎小馒头 时间: 2025-3-20 09:58

Santz 发表于 2025-3-19 17:05
编译问题，我用 2022.2 跑了几个小时，正常完成计算。 aimd.out

谢谢您，我一会重新编译试试

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