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标题: multiwfn产生的molden文件用multiwfn能否绘制原子轨道的径向分布函数图 [打印本页]

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Author: hehe 时间: 2025-3-19 16:51
标题: multiwfn产生的molden文件用multiwfn能否绘制原子轨道的径向分布函数图
本帖最后由 hehe 于 2025-3-19 18:46 编辑

请问Sob老师，molpro产生的molden文件用multiwfn能否绘制分子的不同原子轨道的径向分布函数图？
谢谢老师！

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Author: sobereva 时间: 2025-3-19 18:21
分子没有一般意义的原子轨道（除非是指NAO轨道之类）
如果你指具有原子轨道特征的分子轨道（如下文说的里德堡轨道），可以
图解电子激发的分类
http://sobereva.com/284（http://bbs.keinsci.com/thread-840-1-1.html）

作者
Author: beefly 时间: 2025-3-19 18:49
如果你说的是那种带节点的径向分布，可以先绘制一维的径向电子密度，并保存数据文件。然后手工编辑数据，把密度值乘以球面积（如果只关心曲线形状，也可以直接乘以r^2），然后用matlab、origin画图

作者
Author: hehe 时间: 2025-3-19 18:59

sobereva 发表于 2025-3-19 18:21
分子没有一般意义的原子轨道（除非是指NAO轨道之类）
如果你指具有原子轨道特征的分子轨道（如下文说的里 ...

您好老师，我更新了一下帖子。我想仿照LrF的径向分布函数图，绘制我的体系的径向分布函数图。
我的疑惑是molpro得到的.molden文件是针对于分子的，我看到您的贴子里谈到关于用高斯绘制原子的径向分布函数的方法，那么对于分子的话是不是需要将.fch文件中分子轨道分解回原子轨道，然后进行绘制呢？
还有一个问题是我用molpro得到的.molden文件利用multiwfn转换成.fch文件，进行径向分布函数的绘制是否可行呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-20 04:18

hehe 发表于 2025-3-19 18:59
您好老师，我更新了一下帖子。我想仿照LrF的径向分布函数图，绘制我的体系的径向分布函数图。
我的疑惑 ...

你贴的那个图意义不明
若要从分子中还原出原子轨道，可以用Multiwfn基于NBO程序给出的NAO轨道绘制
我只能告诉你Multiwfn绘制rdf的功能对任何体系都是普适的，只要提供波函数文件就行，Multiwfn支持的波函数文件情况在下文说得非常完整，molpro的molden文件被Multiwfn直接支持
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379（http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html）

另参考
电子空间范围<r^2>和电子径向分布函数的含义以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/616（http://bbs.keinsci.com/thread-25075-1-1.html）

作者
Author: hehe 时间: 2025-3-20 09:35

sobereva 发表于 2025-3-20 04:18
你贴的那个图意义不明
若要从分子中还原出原子轨道，可以用Multiwfn基于NBO程序给出的NAO轨道绘制
我只 ...

谢谢老师

作者
Author: hehe 时间: 2025-3-20 17:50

beefly 发表于 2025-3-19 18:49
如果你说的是那种带节点的径向分布，可以先绘制一维的径向电子密度，并保存数据文件。然后手工编辑数据，把 ...

您好老师，我是想看分子中的原子轨道的在平衡核间距处的重叠情况。我用molpro计算得到的.molden文件只是一个点的波函数文件，但是我画图时应该是需要每个R处的.molden文件，我这样想对吗？如果对的话，在molpro中如何得到每个点的.molden文件呢？

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