计算化学公社

标题: 实验为主体的组里，转到计算化学方向是否可行？ [打印本页]

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-6 16:26
标题: 实验为主体的组里，转到计算化学方向是否可行？
研究生一名，第二年。经过一段时间的实验摸索发现自己对做实验实在是没有兴趣。后来偶然发现组里和其他组合作使用高斯作图，于是开始学习自己使用gaussian完成一些组里常用的任务。经过一个半月的摸索感觉自己大致摸到了这个门槛，并产生了把方向换到计算化学的想法。而老师的意见还是两者都顾一下，既能做实验又懂一些计算的东西，这样这个东西是我的，好发文章。但是我本人确实对实验不感兴趣；而做计算虽然有兴趣，可毕竟不是我原来所了解的领域，缺很多相应的基础。想问一下大家，这种情况下我转到纯计算方向可行吗？

作者
Author: jiangning198511 时间: 2017-3-6 16:51
两个都搞文章会好发一下，单一搞计算不好找工作

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-3-6 16:57
本帖最后由 liyuanhe211 于 2017-3-6 16:59 编辑

个人觉得如果只是想混个学位、将来不玩化学、组里又支持买些硬件之类兴许可以；但如果将来就想完全转去做计算，要注意在实验组做计算不要搞得组里的实验技术没学到，计算也没什么优势。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-6 17:02

jiangning198511 发表于 2017-3-6 16:51
两个都搞文章会好发一下，单一搞计算不好找工作

确实是这个道理。不过感觉还是要读博，工作暂时不去担心了。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-6 17:06

liyuanhe211 发表于 2017-3-6 16:57
个人觉得如果只是想混个学位、将来不玩化学、组里又支持买些硬件之类兴许可以；但如果将来就想完全转去做计 ...

组里就配了一台一万左右的主机，本来也就是想做点简单的计算。我是学得过程中感觉很有意思，但自己基础又不扎实。其实道理我也懂，就是不想做实验，哎。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-3-6 17:08

wrtgcn 发表于 2017-3-6 17:06
组里就配了一台一万左右的主机，本来也就是想做点简单的计算。我是学得过程中感觉很有意思，但自己基础又 ...

去做计算的动机如果是“非常想认真做计算”（注意并非是刚开始玩的新鲜感），还好；如果相对而言、更强的搞计算动机是“非常不想做实验”，就比较危险了。

作者
Author: ChrisZheng 时间: 2017-3-6 17:10
就像上面老师说的那样，实验组不做实验很危险；优势也相对大，因为理论实验结合相对好发文章。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-6 17:18

liyuanhe211 发表于 2017-3-6 17:08
去做计算的动机如果是“非常想认真做计算”（注意并非是刚开始玩的新鲜感），还好；如果相对而言、更强的 ...

觉得自己还是会读博的，如果未来3~4年都做极不喜欢的事情会过得很痛苦。计算实在只是刚摸到了皮毛，但我隐约觉得这是我更能接受的继续做科研的方式。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-6 17:20

ChrisZheng 发表于 2017-3-6 17:10
就像上面老师说的那样，实验组不做实验很危险；优势也相对大，因为理论实验结合相对好发文章。

但是如果我自己不动手，很可能这个结合的产物就不是我的。所以有点纠结。

作者
Author: bzy2570 时间: 2017-3-6 17:33

jiangning198511 发表于 2017-3-6 16:51
两个都搞文章会好发一下，单一搞计算不好找工作

同意，哈哈哈

作者
Author: 小范范1989 时间: 2017-3-6 18:55
问题是，如果你在实验组搞点计算，你们的文章应该还是以实验为主吧。如果这样的话，你做了一点计算，但是实验室别人做的。这个一座算谁的？
如果自己能做实验又会点计算，这样最好了。
如果脱产搞计算，慢慢学，相信通过sob的这个平台应该能学会。我会一点计算，绝大部分是通过这个平台自学的。
个人见解。

作者
Author: 冰释之川 时间: 2017-3-6 19:01
关于实验计算两手抓，你可以多和3楼的liyuanhe211李大博士交流交流，人家现在就是两手抓。关于计算化学入门，强烈建议参加sob老师开的量化培训班。

作者
Author: 冰释之川 时间: 2017-3-6 19:01
本帖最后由冰释之川于 2017-3-6 19:02 编辑

个人还是觉得自己动手做点实验，再加上理论计算，会比较容易发高IF的期刊

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-3-6 19:07

冰释之川发表于 2017-3-6 19:01
关于实验计算两手抓，你可以多和3楼的liyuanhe211李大博士交流交流，人家现在就是两手抓。关于计算化学入门 ...

😂冰老师也开始叫李大博士了=͟͟͞͞(꒪ᗜ꒪ ‧̣̥̇)

作者
Author: 冰释之川 时间: 2017-3-6 19:08

liyuanhe211 发表于 2017-3-6 19:07
😂冰老师也开始叫李大博士了=͟͟͞͞(꒪ᗜ꒪ ‧̣&# ...

想了想，喊“李老师”或者“老李”感觉把大博士喊老了，干脆学娃娃的称呼

作者
Author: kevin 时间: 2017-3-6 19:47
楼主，你的情况跟我类似，说说我的感觉吧，
第一个问题：你们组里懂计算的人有多少，懂到什么程度。
我的状态就是，我的导师实验出身，不懂计算，只是可以把握一下文章思路，有一个师姐，但是和我同时起步，平时的交流只能算是讨论，导师利用他的关系找到一个计算出身的老师，但是离着几千公里，只能网络求助，而且也不好意思太频繁。
第二个问题：你所谓的摸到了门槛，是个什么意思，感觉自己能算几个过渡态了？毕竟才一个半月。好在你是要读博士的，钻研的时间还有很多。如果没人能指导细节的东西的话，可能很快你就达到了瓶颈了（个人经验）。
第三个问题：发文章的话，一般来说还是计算+实验，至少其中一个为主，纯理论的话，没有好的idea,档次高的一般不好发。
所以，请楼主慎重考虑。
一家之谈，仅供参考。祝好

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-6 20:47

kevin 发表于 2017-3-6 19:47
楼主，你的情况跟我类似，说说我的感觉吧，
第一个问题：你们组里懂计算的人有多少，懂到什么程度。
我的 ...

1.你说的情况跟我太像了。我们组有个师兄懂一点点，最开始学的时候他给我很多帮助，但是他毕竟主要做实验的，计算只停留在操作gview上。老师是实验方面的完全不懂计算，只是感觉现在的文章一般都结合一下理论计算才对这个略有兴趣。其实她也是联系了人教我的，但毕竟离得远，我也不好意思追着问。况且那个组学的也很粗，好多exploring chemistry with electronic那本书上的问题他们都说不清。
2.门槛指大致能顺利使用高斯部分功能吧。看了sob老师的博客，会用自定义机组会用赝势，可以做预测活性位点的图了。（过渡态我照着书学的，还相当不到位）
3.我也是上网看了很多，发现许多人都表示计算相比实验只难而不简单，但发文章的时候往往做实验的容易发，而且发的好。
不知你现在的情况如何，是否顺利？

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-6 20:49

小范范1989 发表于 2017-3-6 18:55
问题是，如果你在实验组搞点计算，你们的文章应该还是以实验为主吧。如果这样的话，你做了一点计算，但是实 ...

谢谢。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-6 20:52

冰释之川发表于 2017-3-6 19:01
个人还是觉得自己动手做点实验，再加上理论计算，会比较容易发高IF的期刊

谢谢老师。

作者
Author: kevin 时间: 2017-3-6 21:09

wrtgcn 发表于 2017-3-6 20:47
1.你说的情况跟我太像了。我们组有个师兄懂一点点，最开始学的时候他给我很多帮助，但是他毕竟主要做实验 ...

不是很顺利，年前两篇文章都悲剧了，一篇都没有送审，这就是我说的瓶颈吧，好好研究了审稿人的意见，也做了很多咨询，还在努力中，也想过出路的问题，但是自己还是想要在这里搞出点名堂（可能不服气吧）。
楼主如果非常有意愿的话，就换方向吧，不过劝楼主不要放弃实验，哪怕是自己不做，也懂实验是怎么回事儿，到时候请同门顺带做个简单的验证，给人个二作就好了。
祝楼主一切顺利！

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-6 21:59

kevin 发表于 2017-3-6 21:09
不是很顺利，年前两篇文章都悲剧了，一篇都没有送审，这就是我说的瓶颈吧，好好研究了审稿人的意见，也做 ...

谢谢你了。也祝一切顺利！

作者
Author: bnulk 时间: 2017-3-6 23:09
一万多的机器太不够用了，发文章需要计算数据的时候，磨不出来，很惨很惨的。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-6 23:36

bnulk 发表于 2017-3-6 23:09
一万多的机器太不够用了，发文章需要计算数据的时候，磨不出来，很惨很惨的。

如果想要做计算用，大概要多少预算的配置呢？姑且假设就我一个人用吧。

作者
Author: agent99 时间: 2017-3-7 01:36
想做计算最好懂点理论，而不是只会用高斯算个反应，不然以后出路太窄。在（大部分）实验组里做计算的问题就是大家只看你跑出来的结果和实验是否对的上，对不上就换个方法再试试或者干脆就不用这些计算结果，没人和你探讨理论层面的东西，这样对你的计算研究没啥好处，久而久之你很容易就变成个高斯操作工。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-3-7 02:24

wrtgcn 发表于 2017-3-6 23:36
如果想要做计算用，大概要多少预算的配置呢？姑且假设就我一个人用吧。

跟你所在的组做的实验有关。我在有机合成组算些反应，自己一个人用，基本能把价值共8W(政府采购)的三台机器填满，这还是实验和计算一块做的时候，只做计算就会有大量时间在等。

作者
Author: 那丢失的 时间: 2017-3-7 11:02

冰释之川发表于 2017-3-6 19:01
关于实验计算两手抓，你可以多和3楼的liyuanhe211李大博士交流交流，人家现在就是两手抓。关于计算化学入门 ...

实验和理论两手抓这是大势所趋吧，我们做实验的，找人合作做计算，这样文章好发多了。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-7 11:45

liyuanhe211 发表于 2017-3-7 02:24
跟你所在的组做的实验有关。我在有机合成组算些反应，自己一个人用，基本能把价值共8W(政府采购)的三台机 ...

就我一个人用的话找老师买3台这样配置的机器不太可能，除非让她感觉到说我在这方面确实能出来成果。但我现在只是刚接触到了一点皮毛，也不知道自己能到什么程度。另外3台机子也没地方放。我希望是再经过一段时间的学习后，至少能在这方面自己写得出文章来（水一点的也可以），再提出把主机升到2~3W左右的配置。哎，边走边看吧。谢谢李老师了。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-7 11:50

agent99 发表于 2017-3-7 01:36
想做计算最好懂点理论，而不是只会用高斯算个反应，不然以后出路太窄。在（大部分）实验组里做计算的问题就 ...

我还想学vasp，这样周期体系也能算了。不过眼下高斯都还用不透。看了一些计算的文章，个人感觉也没有用到太深的理论，也就是把一些常见的能算的参数计算了一下（键长键角各种能量），把掺杂的原子换个几组，就直接说结论了，当然其意义一般是落在已有实验结果的体系下延展。
不过我看的非常少，所以只能说是一个粗浅的个人感受。

作者
Author: cherubic 时间: 2017-3-7 23:44
个人觉得，如果出发点只是逃避实验的话，并不太推荐留在实验组里转行计算。首先在实验组里做计算，导师很难给予太多理论上的指引，遇到具体问题也很难找到人有效讨论。如果仅仅满足拿高斯当黑箱，即使算出了与实验符合的结果，也往往不知其所以然，对自己的职业发展并不太好；实际上计算中总会遇到各种各样的问题，如果没有人指引，全靠自己琢磨，也很有挫败感，其实并不比折腾实验轻松多少。
如果确定要转计算方向的话，要确定自己是真正喜欢计算，而且要找一个做理论的导师作为co-advisor。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2017-3-8 08:53

cherubic 发表于 2017-3-7 23:44
个人觉得，如果出发点只是逃避实验的话，并不太推荐留在实验组里转行计算。首先在实验组里做计算，导师很难 ...

嗯.也在考虑直接换到做计算的组里。

作者
Author: Ferrocene 时间: 2017-3-8 09:09

agent99 发表于 2017-3-7 01:36
想做计算最好懂点理论，而不是只会用高斯算个反应，不然以后出路太窄。在（大部分）实验组里做计算的问题就 ...

赞同

不要到最后实验不会做又没有化学直觉，计算只会跑黑箱程序，两边不靠

作者
Author: raitoliu 时间: 2017-3-8 11:40

wrtgcn 发表于 2017-3-8 08:53
嗯.也在考虑直接换到做计算的组里。

不建议现阶段就转，反正要读博，不如读博再去搞计算，现在还是以论文为导向比较好。

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2017-3-8 13:11

liyuanhe211 发表于 2017-3-6 16:57
个人觉得如果只是想混个学位、将来不玩化学、组里又支持买些硬件之类兴许可以；但如果将来就想完全转去做计 ...

你是在说我吗

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-3-8 15:47

yjcmwgk 发表于 2017-3-8 13:11
你是在说我吗

→_→明明是不断有人在说我自己的

作者
Author: yflchx 时间: 2017-3-18 18:41
找一个国际上的组做榜样。

作者
Author: sonyxu 时间: 2017-3-28 18:44
做软件操做工这个比喻精辟

作者
Author: ssp2493187 时间: 2017-3-30 09:02
参加sob的培训班，当然实验最好不要拉下，一作者发文章还是主要考虑实验，可以以非一作者的身份为组内小伙伴做计算也挺好的，其实我自己做计算还打算博士期间参与实验呢，否则感觉有点纸上谈兵，当然这是个人想法

作者
Author: Mirror 时间: 2017-3-31 10:11
个人觉得：实验为主，计算为辅助比较好

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