计算化学公社

标题: 求助如何考察先生成键后断开同一根键的反应 [打印本页]

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2877321934    时间: 2025-3-23 03:45
标题: 求助如何考察先生成键后断开同一根键的反应
各位老师,我在计算一个反应,是吸附在材料上的OH自由基与超氧负离子反应生成单线态氧气和氢氧根离子,如图 (, 下载次数 Times of downloads: 14)
我翻阅文献后,猜测先生成OOOH-自由基中间体,后OOOH-自由基分解生成单线态氧气和氢氧根离子
我已找到OH自由基跟超氧负离子反应生成OOOH-自由基的过渡态,此时便可以计算出能垒,但突然想到一个问题,这个反应全过程是反应物1:OH自由基和超氧负离子经历过渡态1生成OOOH-自由基中间体,OOOH-自由基中间体再经历过渡态2分解生成单线态氧气和氢氧根离子,过渡态2和过渡态1的结构和能量一模一样,因为生成和断开的键是同一根,总感觉怪怪的,请问各位老师,在这个反应中,过渡态1和过渡态2的结构和能量一致,这是合理的嘛?





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wzkchem5    时间: 2025-3-23 09:13
这个确定不是电子转移机理吗?
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tonganlhy    时间: 2025-3-23 10:31
这明显不一样好吧,生成键的时候是均合(均裂的逆反应),断的时候是异裂,完全不一样。更重要的是,你要像楼上说的考虑是不是电子转移而不需要成键
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2877321934    时间: 2025-3-24 07:52
wzkchem5 发表于 2025-3-23 09:13
这个确定不是电子转移机理吗?

也有可能是,目前实验上未对该反应的机理做表征,您说的电子转移机理我也考虑在内,但我翻阅文献,找到一种机理是生成OOOH-自由基,不过OH自由基去结合吸附在材料上的超氧负离子,跟我这个不太一样,机理如下图, (, 下载次数 Times of downloads: 14) ,所以我打算把两种可能的机理都计算一遍。
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2877321934    时间: 2025-3-24 08:09
tonganlhy 发表于 2025-3-23 10:31
这明显不一样好吧,生成键的时候是均合(均裂的逆反应),断的时候是异裂,完全不一样。更重要的是,你要像 ...

老师您说的很有道理,从化学上我也觉得不一样,不过我尝试把OOOH-的O-O键用柔性扫描拉长,得到个最高点,再把超氧负离子-OH自由基复合物的O-O原子距离用柔性扫描缩短,也得到个最高点,用两个最高点去找过渡态得到的过渡态一模一样,扫描过程和找过渡态均使用了guess=mix关键词,这一现象造成了我的误解
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wzkchem5    时间: 2025-3-24 08:31
2877321934 发表于 2025-3-24 08:09
老师您说的很有道理,从化学上我也觉得不一样,不过我尝试把OOOH-的O-O键用柔性扫描拉长,得到个最高点, ...

(1)guess=mix并不保证得到的一定是自旋破缺的波函数,需要手动检查实际收敛到了什么波函数;(2)两个自由基复合,或者一根化学键均裂,如果有过渡态,过渡态并非一定是自旋破缺的
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wzkchem5    时间: 2025-3-24 08:31
2877321934 发表于 2025-3-24 07:52
也有可能是,目前实验上未对该反应的机理做表征,您说的电子转移机理我也考虑在内,但我翻阅文献,找到一 ...

如果这个OOOH自由基是纯实验的文献提出的,且没有直接的实验证据,那么不要信
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2877321934    时间: 2025-3-24 08:43
wzkchem5 发表于 2025-3-24 08:31
如果这个OOOH自由基是纯实验的文献提出的,且没有直接的实验证据,那么不要信

这个机理确实是纯实验的文献提出的,而且没实验证据,不过引用了一篇Chemical Review,但我去看了那篇Chemical Review并没有看到里面有提到OOOH-自由基。此外想询问一下老师,计算这个反应的电荷转移,是用Marcus理论计算吗?
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wzkchem5    时间: 2025-3-24 12:41
2877321934 发表于 2025-3-24 08:43
这个机理确实是纯实验的文献提出的,而且没实验证据,不过引用了一篇Chemical Review,但我去看了那篇Che ...

对,Marcus理论精度不高,但比它精度高的方法都很麻烦
作者
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2877321934    时间: 2025-3-25 06:16
wzkchem5 发表于 2025-3-24 12:41
对,Marcus理论精度不高,但比它精度高的方法都很麻烦

好的,谢谢老师的解答。




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