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标题: 求助使用multiwfn和vmd作图的一些问题 [打印本页]

作者
Author: yangxuesong 时间: 2025-3-23 10:34
标题: 求助使用multiwfn和vmd作图的一些问题
本帖最后由 yangxuesong 于 2025-3-23 10:34 编辑

各位老师大家好我是一个新手，最近在学习multiwfn和vmd作图但是遇到1个问题需要大家帮忙指导一些谢谢大家
我跟着sobe老师的教程对分子之间的相互作用使用Multiwfn做Hirshfeld surface分析直观展现分子晶体和复合物中的相互作用，我跟着教程得到了正常的multiwfn的Hirshfeld surface图，
后续，我就安装教程去vmd作图，但是做出来的图是黑色的，不知道为什么，这些分子之间肯定有相互作用力，大概是2.8 A左右是C-Hπ相互作用。我用的vmd版本是1.93版本，2个版本都试了，都不行，为了排除是软件的问题，我试了另外一个sobe老师之前教程里面的一个分子，这个分子确实可以正常显示，说明应该不是软件问题。所以现在想咨询一下，怎么将他弄成正常的颜色呀
这是我hirsh_rho.vmd的文本我看了教程里面是只能说，蓝，白，红，但是这个黑色不知道为什么会出现。

谢谢大家了
color Display Background white
axes location Off
display depthcue off
display rendermode GLSL
color scale method BWR
#light 3 on

material change specular Translucent 0.200000
material change diffuse Translucent 0.5
material change Opacity Translucent 0.85
set colorhigh 0.015

mol new surf.cub
mol addfile mapfunc.cub
mol modstyle 0 top Licorice 0.200000 17.000000 17.000000
mol addrep top
mol modstyle 1 top Isosurface 0.5 0 0 0 1 1
mol modmaterial 1 top Translucent
mol modcolor 1 top Volume 1
mol scaleminmax top 1 0.0 $colorhigh

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-23 13:56
注意正确拼写sobereva

用本论坛的VMD 1.9.3 64bit版再试。还不行就用tachyon渲染看是否能正常得到结果。还不行就换机子

作者
Author: yangxuesong 时间: 2025-3-23 21:26

sobereva 发表于 2025-3-23 13:56
注意正确拼写sobereva

用本论坛的VMD 1.9.3 64bit版再试。还不行就用tachyon渲染看是否能正常得到结果。 ...

谢谢sobereva老师我试试

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