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标题: 求助:固液界面模拟后为什么固体和液体会错开 [打印本页]

作者
Author:
Lisy    时间: 2025-3-23 10:54
标题: 求助:固液界面模拟后为什么固体和液体会错开
我用gromacs模拟一个固液界面体系,在模拟前结构是正常的,可是为什么跑完平衡模拟后固液界面会错开呢?固体我是有设置冻结的

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sobereva    时间: 2025-3-23 13:58
没什么异常,让原子卷回到盒子里就完了,要么你把固体部分设为消平动的组
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Lisy    时间: 2025-3-23 16:24
sobereva 发表于 2025-3-23 13:58
没什么异常,让原子卷回到盒子里就完了,要么你把固体部分设为消平动的组

好的,谢谢sob老师
作者
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x^x    时间: 2025-3-25 22:01
Lisy 发表于 2025-3-23 16:24
好的,谢谢sob老师

您好,请问您的问题是如何解决的呢?我现在遇到了和您同样的问题,能量最小化之后的结构还是正常的,跑完平衡相之后固体层错开了。sob老师回复的“让原子卷回到盒子里”具体如何操作呢,还请指教。




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