计算化学公社

标题: DFT计算丙二酸和Zr络合应该是电荷0 自旋多重度1吗？ [打印本页]

作者
Author: 哈哈哈哈哈aaa 时间: 2025-3-23 13:55
标题: DFT计算丙二酸和Zr络合应该是电荷0 自旋多重度1吗？
这是丙二酸和Zr结合的输入文件，按照6配位考虑Zr，其中两个OH脱H与丙二酸结合，那这时候电荷、自旋多重度应该设置为多少呢？

作者
Author: 北大-陶豫 时间: 2025-3-23 14:11
你这……丙二酸二负离子的亚甲基氢就杵在 [Zr(OH)4] 的两个氧中间？
摆结构是要符号化学直觉的，不是随便一摆就行的。明显应该让丙二酸二负离子的两个羧基分别连出一根配位键。

作者
Author: 哈哈哈哈哈aaa 时间: 2025-3-23 15:08
本帖最后由哈哈哈哈哈aaa 于 2025-3-23 15:30 编辑

北大-陶豫发表于 2025-3-23 14:11
你这……丙二酸二负离子的亚甲基氢就杵在 [Zr(OH)4] 的两个氧中间？
摆结构是要符号化学直觉的，不是随便 ...

老师您好！那我正确绘制了之后是应该设置电荷-2，自旋多重度1吗？

作者
Author: tonganlhy 时间: 2025-3-23 21:29

哈哈哈哈哈aaa 发表于 2025-3-23 15:08
老师您好！那我正确绘制了之后是应该设置电荷-2，自旋多重度1吗？

六配位的话这样设没问题，主要丙二酸要拿掉两个质子

作者
Author: 北大-陶豫 时间: 2025-3-23 22:11

哈哈哈哈哈aaa 发表于 2025-3-23 15:08
老师您好！那我正确绘制了之后是应该设置电荷-2，自旋多重度1吗？

没啥问题了，电荷和多重度都是对的。
当前结构，跟Zr配位的六个氧偏离八面体结构挺多的，不过还不算离谱，应该不会影响优化过程中达到正确的结构。
另外，可能需要确认一下丙二酸的亚甲基氢会不会被拔掉一个。

作者
Author: 哈哈哈哈哈aaa 时间: 2025-3-24 08:03

tonganlhy 发表于 2025-3-23 21:29
六配位的话这样设没问题，主要丙二酸要拿掉两个质子

好的好的谢谢您的指导！

作者
Author: 哈哈哈哈哈aaa 时间: 2025-3-24 08:04

北大-陶豫发表于 2025-3-23 22:11
没啥问题了，电荷和多重度都是对的。
当前结构，跟Zr配位的六个氧偏离八面体结构挺多的，不过还不算离谱 ...

好的好的谢谢您的指导！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)