计算化学公社

标题: 请问在固定温度和压强的情况下如何找两个分子的最优构型 [打印本页]

作者
Author: skadewawawa 时间: 2025-3-23 14:54
标题: 请问在固定温度和压强的情况下如何找两个分子的最优构型
各位老师好，最近希望找到一个苯酚分子和一个硝基苯分子在323K和1atm下的最优构型，
拜读了 “genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具” 这篇博文后用genmer结合molclus生成并用Gaussian优化一系列结构，我准备将这些结构比较能量以及计算323K下的根据Boltzmann分布，但是这些是不是没办法对应于题目要求的50摄氏度和1atm的要求呢？第一次接触这类分子团簇，请问各位老师有没有什么建议?

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-3-23 15:11
仔细阅读http://sobereva.com/423

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-24 10:08
molclus做构型搜索给你的是各种势能面极小点结构，同时得到它们的电子能量，这都是独立于温度和压力的。仅当你对这些结构算热力学量（以及依赖于相对自由能的Boltzmann分布）的时候，才能体现温度、压力（都是按理想气体热力学公式算的，至多再考虑隐式溶剂模型）。详见楼上提到的我的博文，并且建议把下文提到的Shermo手册附录的热力学数据计算常识看看
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552（http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html）

作者
Author: skadewawawa 时间: 2025-3-25 22:29
好的谢谢各位老师

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