计算化学公社

标题: 使用新版Intel oneMKL在编译和测试QE时出现的问题 [打印本页]

作者
Author: UW_0728. 时间: 2025-3-23 17:59
标题: 使用新版Intel oneMKL在编译和测试QE时出现的问题
本帖最后由 UW_0728. 于 2025-3-23 18:58 编辑

本人编译QE7.4.1版本，预先安装有Open MPI 5.0.7版本，之前安装CP2K也装有openblas等库。按照卢老师的帖子“Quantum ESPRESSO在Linux下的安装方法 - 第一性原理 (First Principle) - 计算化学公社”安装时，第二步是安装Intel MKL（“为了让QE能利用效率很高的MKL数学库来提升计算速度，应当在编译QE前先把MKL装上”），而目前Intel MKL在官网上已经更为Intel oneMKL，可下载的最新版本为2025.0.1，目前已安装好且配置好环境变量（source /home/uw/intel/oneapi/mkl/2025.0/env/vars.sh）。
接下来到QE源代码文件夹里执行“./configure”指令，出现以下信息：
checking for library containing dgemm... no
MKL not found
in /home/uw/intel/oneapi/mkl/2025.0/lib/intel64: checking for library containing dgemm... no
MKL not found
......
最后的配置结果为
The following libraries have been found:
  BLAS_LIBS= -lopenblas
  LAPACK_LIBS=-L/home/uw/OpenMPI/lib  -lopenblas
  FFT_LIBS= -lfftw3
  MPI_LIBS= -lmpi
并没有调用MKL库。
后来，调整了OpenMPI的安装路径到/opt/下，并换用了Intel® Fortran Essentials（包括oneMKL和ifx两部分，考虑到intel处理器下ifx可能比gfortran更快；安装在/opt/下），发现configure时可以识别MKL库（后来发现是偶然原因）：
原先有MKL not found提示的地方显示为：
checking for library containing dgemm... -lmkl_gf_lp64
并显示如下结果：
The following libraries have been found:
  BLAS_LIBS=  -lmkl_gf_lp64  -lmkl_sequential -lmkl_core
  LAPACK_LIBS=
  SCALAPACK_LIBS=-lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_openmpi_lp64
  FFT_LIBS=
接下来的编译非常顺利。然而，在测试时，虽然任务能顺利结束，但JOB DONE. 后面还会紧接一行：
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DIVIDE_BY_ZERO
请问这种问题是哪一个环节出现的？可以在任务运行成功的前提下忽略吗？谢谢解答！

作者
Author: rabbitkiller 时间: 2025-3-23 19:26
看一下环境变量MKLROOT有没有赋值

作者
Author: UW_0728. 时间: 2025-3-23 19:33

rabbitkiller 发表于 2025-3-23 19:26
看一下环境变量MKLROOT有没有赋值

有的，export MKLROOT=/opt/intel/oneapi/mkl/2025.0

作者
Author: UW_0728. 时间: 2025-3-23 19:35

UW_0728. 发表于 2025-3-23 19:33
有的，export MKLROOT=/opt/intel/oneapi/mkl/2025.0

但是按理来说有了source vars.sh这样的命令应该不需要这个

作者
Author: rabbitkiller 时间: 2025-3-23 19:43

UW_0728. 发表于 2025-3-23 19:35
但是按理来说有了source vars.sh这样的命令应该不需要这个

感觉是编译器的问题。以前用gcc编译过qe，也有过类似经历，就是计算结束后出现一堆警告信息……我就忽略它们了

作者
Author: Shana 时间: 2025-4-17 22:02

rabbitkiller 发表于 2025-3-23 19:43
感觉是编译器的问题。以前用gcc编译过qe，也有过类似经历，就是计算结束后出现一堆警告信息……我就忽略 ...

这个IEEE_DIVIDE_BY_ZERO挺致命的，会造成部分计算结果出现较达的数值浮动。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)