计算化学公社

标题: 求助:请问vmd里没有显示的键如何显示呢 [打印本页]

作者
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Lisy    时间: 2025-3-25 16:26
标题: 求助:请问vmd里没有显示的键如何显示呢
各位老师,我想在vmd里显示含有PF6的电解液,可是P和F在VMD里面没有显示成键,我除了手动去一个个加键这种笨方法之外,还有没有其他什么方便的方法可以快速让P和F都显示成键呢?


作者
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student0618    时间: 2025-3-25 17:07
谈谈VMD可视化程序的连接关系的判断和设置问题
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 6&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)

作者
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sobereva    时间: 2025-3-25 22:29
三种做法皆可,依次更复杂,但依次更解决根本问题:(1)改成dynamic bonds显示方式 (2)利用VMD命令行改大原子半径然后重新判断成键 (3)用脚本批量修改拓扑关系增加键




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