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标题: 求助:请问gromacs统计数密度分布和质量密度分布之间能否进行换算 [打印本页]

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Lisy    时间: 2025-3-27 15:10
标题: 求助:请问gromacs统计数密度分布和质量密度分布之间能否进行换算
求助:请问各位老师gromacs统计数密度分布和质量密度分布之间能否进行换算,gmx density 命令软件默认算的是质量密度,我知道加-dens number 是算数密度,请问这两者之间是否可以通过乘以一个系数来进行换算

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sobereva    时间: 2025-3-27 20:27
如果被统计的组的原子的质量只有一种,显然数密度乘以单个原子的质量就是质量密度
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Lisy    时间: 2025-3-27 22:00
sobereva 发表于 2025-3-27 20:27
如果被统计的组的原子的质量只有一种,显然数密度乘以单个原子的质量就是质量密度

谢谢卢老师,比如我统计水分子的数密度在界面的分布,其第一个主峰的数密度数值是132/nm-3,我换成统计质量密度统计出来其数值是1500kg/m3,感觉好像不是差了18这个系数,这是为什么呢?
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sobereva    时间: 2025-3-27 22:18
Lisy 发表于 2025-3-27 22:00
谢谢卢老师,比如我统计水分子的数密度在界面的分布,其第一个主峰的数密度数值是132/nm-3,我换成统计质 ...

你统计氧的数密度,乘以16,就成了质量密度
不能统计水,因为H和O的原子质量不同
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Lisy    时间: 2025-3-27 22:36
sobereva 发表于 2025-3-27 22:18
你统计氧的数密度,乘以16,就成了质量密度
不能统计水,因为H和O的原子质量不同

就是如果统计的是水,就没办法这样去换算了,但得到的这个水的质量密度分布还是有意义的对吧
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sobereva    时间: 2025-3-27 22:45
Lisy 发表于 2025-3-27 22:36
就是如果统计的是水,就没办法这样去换算了,但得到的这个水的质量密度分布还是有意义的对吧


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Lisy    时间: 2025-3-27 22:54
sobereva 发表于 2025-3-27 22:45

好的,非常感谢卢老师!




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