计算化学公社

标题: ORCA做SOC分析时出现ORCA finished by error termination in CIS报错 [打印本页]

作者
Author:
zhaoxiaopeng    时间: 2025-3-28 13:31
标题: ORCA做SOC分析时出现ORCA finished by error termination in CIS报错
各位老师好,我在做ORCA,soc分析时无论修改内存为100000还是修改核数为40,32,16,8都会报错,请各位老师帮忙看看哪里出现问题了,谢谢老师
(, 下载次数 Times of downloads: 14)
(, 下载次数 Times of downloads: 6)
第一个是输入文件第二个是输出文件
文件是在超算平台上进行,其中文件大概运行了十多分钟就会开始报错。

作者
Author:
imasen    时间: 2025-3-28 14:34
超算平台单核有300GB这么大的内存么,一般商用的做量化计算的单核也就4GB左右吧?而且如果你不是独占节点,就算用的节点有这么多内存也不会全部分配到你的任务上。你可以看一下你用的节点的总核数和总的内存,比如64核256GB,你在作业提交脚本设置独占节点64核,orca的输入文件里只用8核,这样单核内存就可以设置32GB了(实际写的时候建议少些一点,比如30000MB)。
作者
Author:
zhaoxiaopeng    时间: 2025-3-28 14:59
imasen 发表于 2025-3-28 14:34
超算平台单核有300GB这么大的内存么,一般商用的做量化计算的单核也就4GB左右吧?而且如果你不是独占节点, ...

老师您好,我用的是学校的超算平台有64个核和2t内存,但是无论怎么修改还是运行了之后会出错,期间也改了内存参数为3w,还是出错了
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2025-3-28 15:49
不要用这么低版本的ORCA,升级成6.0.1版再试
作者
Author:
imasen    时间: 2025-3-28 15:56
本帖最后由 imasen 于 2025-3-28 16:25 编辑
zhaoxiaopeng 发表于 2025-3-28 14:59
老师您好,我用的是学校的超算平台有64个核和2t内存,但是无论怎么修改还是运行了之后会出错,期间也改了 ...

你现在设置的内存(~6.8TB)都超过了节点满核总内存了,保险的方法就是独占节点,用少一点的核跑,核数*内存设置得比总内存少一点。我在64核节点上用8核*3000MB跑都没问题,你这个体系又不是特别大。另外你的orca版本也太低了。 (, 下载次数 Times of downloads: 2)
作者
Author:
naonao5205    时间: 2025-3-28 17:34
ORCA %maxcore设置的是每个核心的内存(MB),乘起来才是所有申请的。同时,你提交任务脚本申请的节点内存应该略大于ORCA申请的所有内存,因为他偶尔可能会超一点点。
作者
Author:
Santz    时间: 2025-3-28 19:31
这个任务根本就用不到那么多内存,ORCA-6.0.1 使用 64 核,最大使用内存才 218GB。
作者
Author:
wal    时间: 2025-3-28 22:33
Santz 发表于 2025-3-28 19:31
这个任务根本就用不到那么多内存,ORCA-6.0.1 使用 64 核,最大使用内存才 218GB。

这个218出自哪里
作者
Author:
Santz    时间: 2025-3-29 23:37
wal 发表于 2025-3-28 22:33
这个218出自哪里

任务监控

作者
Author:
Stardust0831    时间: 2025-3-30 12:42
Santz 发表于 2025-3-29 23:37
任务监控

前辈,这个任务监控是怎么实现的呀?
作者
Author:
Santz    时间: 2025-3-30 13:03
本帖最后由 Santz 于 2025-3-30 13:06 编辑


issue 里有对 cgroup2 的支持
部署略麻烦,如果想简单点就用 jobperf

可视化面板。
slurm 自带的命令,但是一般用户作业完成后的效率评价。如果想监控作业运行过程中的信息,还是前三者


----------------------------------
如果想简单点用的话,推荐 jobperf 即可。

作者
Author:
Santz    时间: 2025-3-30 13:04
Santz 发表于 2025-3-30 13:03
  • jobperf

    issue 里有对 cgroup2 的支持

  • @Stardust0831
    作者
    Author:
    Stardust0831    时间: 2025-3-30 17:35
    Santz 发表于 2025-3-30 13:04
    @Stardust0831

    谢谢老师!




    欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3