计算化学公社

标题: Multiwfn计算LOL-pi的color-filled map不出现图形原因? [打印本页]

作者
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lp2014    时间: 2017-3-9 09:35
标题: Multiwfn计算LOL-pi的color-filled map不出现图形原因?
图中分子是平面性分子,欲研究其pi电子共轭路径。故用Multiwfn计算了其LOL-pi的color-fiiled map(分子平面上方1.2bohr和0.8a处),然而出现的图形界面数值都是0,并没有出现pi电子共轭路径,是什么原因呢?

作者
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sobereva    时间: 2017-3-9 11:00
把输入文件和完整的操作步骤贴出来
作者
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lp2014    时间: 2017-3-9 12:41
sobereva 发表于 2017-3-9 11:00
把输入文件和完整的操作步骤贴出来


7-pi-opt.fchk  //分子平面在XY平面上
100
22    //设定所有sigma轨道占据数为0以去除其对LOL的贡献
1
2
0   //回主菜单
4
10
1
[Enter]
1
1.2
这是操作步骤,附件是分子的fchk文件,谢谢
作者
Author:
sobereva    时间: 2017-3-9 18:07
lp2014 发表于 2017-3-9 12:41
7-pi-opt.fchk  //分子平面在XY平面上
100
22    //设定所有sigma轨道占据数为0以去除其对LOL的贡献
...

你这个体系不是纯平面体系。运行完100-22提示
Expected pi orbitals, occupation numbers and orbital energies(eV) are:
Total number of pi orbitals:     0
Total number of electrons in pi orbitals:    0.000000
Total number of inner electrons:    66
当前pi轨道认出来0个,之后又选2让其它轨道占据数都清零,等于所有轨道占据数都为0了,显然结果什么也没有。

进主功能0的时候就会显示当前体系原子的坐标
    1(C ) --> Charge:  6.000000  x,y,z(Bohr):   1.366483   2.497825   0.005845
    2(C ) --> Charge:  6.000000  x,y,z(Bohr):   2.703143   0.159884   0.005817
    3(C ) --> Charge:  6.000000  x,y,z(Bohr):   1.342785  -2.113703  -0.003221
    4(C ) --> Charge:  6.000000  x,y,z(Bohr):  -1.342762  -2.113709   0.003463
    5(C ) --> Charge:  6.000000  x,y,z(Bohr):  -2.703130   0.159872  -0.005584
    6(C ) --> Charge:  6.000000  x,y,z(Bohr):  -1.366470   2.497807  -0.005593
    7(N ) --> Charge:  7.000000  x,y,z(Bohr):  -2.352360   4.785225  -0.009693
...
可见原子的Z坐标并非都为0,这种纯平面体系没法用100-22自动寻找pi轨道。
你在gview里把体系对称化成C2v,重新优化,用所得的fch就行了




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