计算化学公社

标题: 请教脂质体囊泡力场适配问题 [打印本页]

作者
Author:
230820071    时间: 2025-3-29 18:28
标题: 请教脂质体囊泡力场适配问题
我先使用insane构建了一个DPPC的脂质体双分子层,然后使用bumpy构建成囊泡,但是添加任何与脂质体相关的力场时都在报错,一直识别不出NC3,具体如下
“Atom NC3 in residue DPPC 1 was not found in rtp entry DPPC with 130 atoms while sorting atoms.”想请教各位老师如何解决

作者
Author:
student0618    时间: 2025-3-29 21:57
rtp中该原子是什么名字?
作者
Author:
230820071    时间: 2025-3-29 22:08
student0618 发表于 2025-3-29 21:57
rtp中该原子是什么名字?

原子是N。是这样的,我还看到有说insane做出来的就是martini粗粒化过的,会不会和这个有关?另外,想问一下怎么做出完全封闭的囊泡




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3