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标题: 计算碳酸钾及其氢键作用形成物的静电势是否需要加上钾离子 [打印本页]

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gwh1206    时间: 2025-4-1 10:15
标题: 计算碳酸钾及其氢键作用形成物的静电势是否需要加上钾离子
各位老师好,使用gaussian计算碳酸钾、碳酸钾和乙二醇通过氢键作用形成的低熔点混合物的静电势时,想问一下是否需要去除钾离子再计算两种物质的静电势。十分感谢!

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Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2025-4-1 10:37
这篇文章用GROMACS跑动力学并做簇分析(相当于构象搜索,这对当前目的也很重要)的结果来看,钾离子和碳酸根离子在乙二醇里可以共同、也可以分别形成多种溶剂化团簇。
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sobereva    时间: 2025-4-1 22:06
要说清楚算静电势的目的是什么,不同目的有不同考虑
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gwh1206    时间: 2025-4-3 22:53
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-1 10:37
从这篇文章用GROMACS跑动力学并做簇分析(相当于构象搜索,这对当前目的也很重要)的结果来看,钾离子和碳 ...

非常感谢您!
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gwh1206    时间: 2025-4-3 23:04
sobereva 发表于 2025-4-1 22:06
要说清楚算静电势的目的是什么,不同目的有不同考虑

好滴,老师!想计算静电势的目的主要是想通过静电势看两者通过氢键结合以后,电势负的部分更负以此证明更容易发生亲核(两者单独和PVDF反应条件较高,结合以后会在80度反应)。还有一个目的是确定氢键的形成部位。所以,不确定是否需要加入钾离子计算。
作者
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sobereva    时间: 2025-4-4 16:36
gwh1206 发表于 2025-4-3 23:04
好滴,老师!想计算静电势的目的主要是想通过静电势看两者通过氢键结合以后,电势负的部分更负以此证明更 ...

形成氢键一般不会造成显著的电子转移,因此不会因为电子结构的改变而变得更亲核什么的。但同时存在另一个物质,有可能对于形成反应复合物、过渡态的结构方面起到辅助作用,这不是光看静电势能判断的,得拿实际的反应结构讨论。

实际环境中,如果K+和碳酸根主要是分离状态存在,就不带K+,否则带K+。所以看实际情况




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